3D Slicer - 随笔分类(第2页) - 一杯清酒邀明月

3D Slicer 体系结构1

摘要：1.系统架构 Slicer平台是基于VTK、ITK、CTK、KWWidgets、CMake、Qt和Python等开源软件开发的。主要采用的编程语言是C++、Python、JavaScript。 Slicer体系架可以分为3层：基础层、算法层和应用层。基础层由操作系统提供的最底层的库，典型如Ope 阅读全文

posted @ 2021-01-05 13:40 一杯清酒邀明月阅读(1483) 评论(0) 推荐(0) 编辑

3D Slicer FAQ-3

摘要：1.什么是拓展？拓展，Extension，可以视为捆绑了一个或者多个模块module的封装包（delivery package）。安装一个拓展功能之后，相关的模块将会以内置模块形式呈现给用户。 Slicer目前拥有相当数量的拓展，具体参见如下网址： https://www.slicer.org/w 阅读全文

posted @ 2021-01-05 13:39 一杯清酒邀明月阅读(300) 评论(0) 推荐(0) 编辑

3D Slicer FAQ-2

摘要：1.MRML 1.1 Introduction MRML用来描述Slicer中的场景并映射到他的数据模型。MRML库提供了一个API用于管理医学图像数据类型（体数据、模型、变换、基准点、相机等）和可视化；每种数据类型都以一个特殊的MRML node(节点)来呈现；MRML Scene就是所有MRM 阅读全文

posted @ 2021-01-05 13:38 一杯清酒邀明月阅读(300) 评论(0) 推荐(0) 编辑

3D Slicer FAQ-1

摘要：1.Core Feature 应该采用C++还是Python进行开发？这并没有统一的答案，因为Slicer应用各种语言和技术进行开发。 MRML和大多数逻辑操作符是采用c++开发的，如VTK子类应用和大多数的界面是采用C++开发的，如QWidget子类很多和C++捆绑在一起的重要模块，如Lab 阅读全文

posted @ 2021-01-05 13:35 一杯清酒邀明月阅读(340) 评论(0) 推荐(0) 编辑

3D Slicer 编译、调试、规范化的开发

摘要：1.编译 Step1：CMake生成Slicer工程文件使用Cmake生成Slicer的解决方案（Solution）包括两小点：指定源代码目录：C:/myProjects/Slicer4；目标目录：C:/myProjects/Slicer4-SuperBuild-Debug Configure后阅读全文

posted @ 2021-01-05 13:34 一杯清酒邀明月阅读(1813) 评论(1) 推荐(0) 编辑

3D Slicer 开发者必晓ABC

摘要：1.简言之 3Dslicer基于NA-MIC工具包开发而来，主要使用的编程语言是C++。其使用的NA-MIC工具包包括VTK、ITK、CTK、Cmake、Qt、Python。 NA-MIC, the National Alliance for Medical Imaging Computing.NA 阅读全文

posted @ 2021-01-05 13:33 一杯清酒邀明月阅读(1068) 评论(0) 推荐(0) 编辑

3D Slicer 模块管理（二）场景视图、体数据、体绘制

摘要：1.场景视图模块（Scene View Module）场景视图用于组织场景数据中多个“实时”视图。用户创建视图数量没有上限，仅需要对场景的参数进行控制。 3DSlicer的场景视图功能通过场景视图模块来实现。为了方便随时操作，Slicer提供快捷工具。界面如下所示： 2.体数据模块（Volumes 阅读全文

posted @ 2021-01-05 13:32 一杯清酒邀明月阅读(740) 评论(0) 推荐(0) 编辑

3D Slicer 模块管理（一）颜色、DCM、数据、模型、注释

摘要：1.颜色管理模块（Colors Module）医学图像处理和可视化时，不同组织希望用不同的颜色来表示。3DSlicer就是采用了颜色管理模块来管理颜色。 1.1 使用方法 Modules->all Modules->Colors Module 1.2 颜色表的管理目前，3DSlicer支持三种颜阅读全文

posted @ 2021-01-05 13:31 一杯清酒邀明月阅读(2069) 评论(0) 推荐(0) 编辑

3D Slicer 数据与帮助

摘要：1.数据加载 1.1 3Dslicer支持的数据格式 Slicer支持多种医学图像数据的处理。由于Slicer的功能通过模块实现。数据类型也由模块来进行使用，某一个模块支持的数据类型可能有多种，例如数据模块可以对场景数据进行读取、写入的操作；体数据模块对影像图数据提供支持，这些影像图数据的格式不仅包阅读全文

posted @ 2021-01-05 13:29 一杯清酒邀明月阅读(978) 评论(0) 推荐(0) 编辑

3D Slicer 图像分割标注教程

摘要：在3D Slicer(4.10.1)中进行三维体数据的图像分割标注。扩展教程：3D Slicer - 医学图像检测标注教程(矩形框)3D Slicer - 医学图像检测标注教程(导入查看标签与修改标签) 1. 读取数据三维体数据一般为DICOM格式或者NIFIT格式，DICOM：将包含.dcm文件阅读全文

posted @ 2021-01-04 11:50 一杯清酒邀明月阅读(4335) 评论(0) 推荐(0) 编辑

3D Slicer 视图窗口控制

摘要：一、3D Viewer 视图窗口控制视角控制左边一块可以控制当前3Dviewer窗口中显示的图像的视角，共有8个方向视角，左 L（Left）、右 R（Right）、前 A（Anterior）、后 P（Posterior）、上 S（Superior）、下 I（Interior）。点击后可以将视角切阅读全文

posted @ 2021-01-04 11:49 一杯清酒邀明月阅读(1582) 评论(0) 推荐(0) 编辑

3D Slicer 视图显示交互控制

摘要：一、窗宽窗位调节（Window/Level，W/L）窗宽（Window）是欲显示医学图像的灰度范围大小，窗位（Level）是欲显示医学图像的灰度位置。一般显示器的显示灰度范围为256级，而医学图像的灰度范围往往远远大于该范围，因此通过显示器显示时不能完全显示所有的灰度级，需要使用窗宽和窗位来共同定阅读全文

posted @ 2021-01-04 11:48 一杯清酒邀明月阅读(1762) 评论(0) 推荐(0) 编辑

3D Slicer 医学图像检测标注教程(矩形框)

摘要：对医学3D图像中的病灶区域进行Detection时，需要提供Bounding Box标签。3D Slicer(4.10.2)中的Segment Editor与Legacy/Editor都可以对三维体数据中的ROI进行矩形标签框注。Segment Editor较为方便，虽然这个模块本身是用于像素级Se 阅读全文

posted @ 2021-01-04 11:47 一杯清酒邀明月阅读(2683) 评论(0) 推荐(0) 编辑

3D Slicer 医学图像检测标注教程(导入查看标签与修改标签)

摘要：对于已经导出的DICOM标签，可能需要在专业医学人员检查之后进行修改。本文介绍如何将已经导出的DICOM标签重新导入3D slicer，并进行修改。一、导入数据打开软件后，首先查看一下Data，把里面的已有的数据全选然后右键点击Delete(删除之前请确认其中的标签已经成功导出了)，这是为了防止阅读全文

posted @ 2021-01-04 11:46 一杯清酒邀明月阅读(4086) 评论(0) 推荐(0) 编辑

3D Slicer 入门及基本控制

摘要：1.用户环境模块面板：显示模块界面，Slicer中功能通过模块化的方式实现；切片窗口：显示三个切片分量，冠状面R、矢状面Y、水平面G；数据探针：用于显示鼠标在切片视图中移动时的实时坐标信息。 1.1 系统主菜单 1.File-文件管理功能 Add Data：添加Slicer数据，可以是一般的S 阅读全文

posted @ 2021-01-04 11:44 一杯清酒邀明月阅读(4115) 评论(0) 推荐(0) 编辑

3D Slicer中文教程-下载及安装方法

摘要：3D Slicer是用于医学图像信息学，图像处理和三维可视化的开源软件平台。通过国家卫生研究院和全球开发人员社区的支持，二十多年来，Slicer为医生，研究人员和公众提供了免费，强大的跨平台加工工具。在多种医疗应用中，包括孤独症，多发性硬化，系统性红斑狼疮，前列腺癌，精神分裂症，矫形生物力学，CO 阅读全文

posted @ 2020-08-07 16:13 一杯清酒邀明月阅读(4017) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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