git中文件内容并没有真正存储在索引(.git/index)或者提交对象中，而是以blob的形式分别存储在数据库中(.git/objects)，并用SHA-1值来校验。 索引文件用识别码列出相关的blob文件以及别的数据。对于提交来说，以树(tree)的形式存储，同样用对于的哈希值识别。树对应着工作目录中的文件夹，树中包含的 树或者blob对象对应着相应的子目录和文件。每次提交都存储下它的上一级树的识别码。
如果用detached HEAD提交，那么最后一次提交会被the reflog for HEAD引用。但是过一段时间就失效，最终被回收，与git commit --amend或者git rebase很像。
git 模型可以抽象为 远程仓库——remote， 本地三级仓库: level1——working directory level2——stage(index) level3——repository(History)
git 各个命令可以理解为在各个仓库间转移数据，各个命令对应对每个仓库输入输出。
便于记忆可以简单分为 低level输入和 高level输入， 注意各level并不一定是相邻的level间转移，可以跨level转移，通过git命令的参数选项来实现，
如常见的 git checkout git reset git commit
| 低level输入 | 高level 输入 | |
| working directory | 手工创建 | git checkout/git stash |
| stage(index) | git add | git reset |
| History(repository) | git commit | git pull |
| remote | git push | - |
根据上述表格，结合git命令各种参数的结合，可以数据在各仓库间的转移，
需要注意的是不论参数如何变化，， 除了git reset 外，上述各命令目的仓库按照如上表所示是确定的，参数和选项来决定数据的来源
基本用法
上面的四条命令在工作目录、暂存目录(也叫做索引)和仓库之间复制文件。
git add files把当前文件放入暂存区域。git commit给暂存区域生成快照并提交。git reset -- files用来撤销最后一次git add files，你也可以用git reset撤销所有暂存区域文件。（操作对象是HEAD）git checkout -- files把文件从暂存区域复制到工作目录，用来丢弃本地修改。（目的是working Directory）
你可以用 git reset -p, git checkout -p, or git add -p进入交互模式。
也可以跳过暂存区域直接从仓库取出文件或者直接提交代码， 如下
git commit -a相当于运行 git add 把所有当前目录下的文件加入暂存区域再运行。git commit.git commit files进行一次包含最后一次提交加上工作目录中文件快照的提交。并且文件被添加到暂存区域。git checkout HEAD -- files回滚到复制最后一次提交。
diff
有许多种方法查看两次提交之间的变动。下面是一些示例。
本质上就是在前言中表述的4个level中任意指定2个仓库进行比较
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commit
提交时，git用暂存区域的文件创建一个新的提交，并把此时的节点设为父节点。然后把当前分支指向新的提交节点。下图中，当前分支是master。 在运行命令之前，master指向ed489，提交后，master指向新的节点f0cec并以ed489作为父节点
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下图中，在master分支的祖父节点maint分支进行一次提交，生成了1800b。 这样，maint分支就不再是master分支的祖父节点。此时，合并 (或者 衍合) 是必须的。
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如果想更改一次提交，使用 git commit --amend。git会使用与当前提交相同的父节点进行一次新提交，旧的提交会被取消
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checkout
checkout命令用于从历史提交（或者暂存区域）中拷贝文件到工作目录，也可用于切换分支。
当给定某个文件名（或者打开-p选项，或者文件名和-p选项同时打开）时，git会从指定的提交中拷贝文件到暂存区域和工作目录。比如，git checkout HEAD~ foo.c会将提交节点HEAD~(即当前提交节点的父节点)中的foo.c复制到工作目录并且加到暂存区域中。（如果命令中没有指定提交节点，则会从暂存区域中拷贝内容。）
注意当前分支不会发生变化(HEAD指向原处)。
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当不指定文件名，而是给出一个（本地）分支时，那么HEAD标识会移动到那个分支（也就是说，我们“切换”到那个分支了），然后暂存区域和工作目录中的内容会和HEAD对应的提交节点一致。新提交节点（下图中的a47c3）中的所有文件都会被复制（到暂存区域和工作目录中）；只存在于老的提交节点（ed489）中的文件会被删除；不属于上述两者的文件会被忽略，不受影响。
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如果既没有指定文件名，也没有指定分支名，而是一个标签、远程分支、SHA-1值或者是像master~3类似的东西，就得到一个匿名分支，称作detached HEAD（被分离的HEAD标识）。这样可以很方便地在历史版本之间互相切换。比如说你想要编译1.6.6.1版本的git，你可以运行git checkout v1.6.6.1（这是一个标签，而非分支名），编译，安装，然后切换回另一个分支，比如说git checkout master。然而，当提交操作涉及到“分离的HEAD”时，其行为会略有不同，详情见在下面。
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HEAD标识处于分离状态时的提交操作
当HEAD处于分离状态（不依附于任一分支）时，提交操作可以正常进行，但是不会更新任何已命名的分支。(你可以认为这是在更新一个匿名分支。)
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一旦此后你切换到别的分支，比如说master，那么这个提交节点（可能）再也不会被引用到，然后就会被丢弃掉了。注意这个命令之后就不会有东西引用2eecb。
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但是，如果你想保存这个状态，可以用命令git checkout -b name来创建一个新的分支。
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- 另外， checkout还有还有如下使用
- 当执行 "git checkout ." 或者 "git checkout -- <file>" 命令时，会用暂存区全部或指定的文件替换工作区的文件。这个操作很危险，会清除工作区中未添加到暂存区的改动。
- 当执行 "git checkout HEAD ." 或者 "git checkout HEAD <file>" 命令时，会用 HEAD 指向的 master 分支中的全部或者部分文件替换暂存区和以及工作区中的文件。这个命令也是极具危险性的，因为不但会清除工作区中未提交的改动，也会清除暂存区中未提交的改 动。
- git checkout -f =等价=> git checkout HEAD . 特别注意，当git checkout -f 不带任何的commit 和文件时，会彻底删除 index 和 working tree未提交内容。
reset
reset命令把当前分支指向另一个位置，并且有选择的变动工作目录和索引。也用来在从历史仓库中复制文件到索引，而不动工作目录。
如果不给选项，那么当前分支指向到那个提交。如果用--hard选项，那么工作目录也更新，如果用--soft选项，那么都不变。
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如果没有给出提交点的版本号，那么默认用HEAD。这样，分支指向不变，但是索引会回滚到最后一次提交，如果用--hard选项，工作目录也同样。（=== checkout ）
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如果给了文件名(或者 -p选项), 那么工作效果和带文件名的checkout差不多，除了索引被更新。
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merge
merge 命令把不同分支合并起来。合并前，索引必须和当前提交相同。如果另一个分支是当前提交的祖父节点，那么合并命令将什么也不做。 另一种情况是如果当前提交是另一个分支的祖父节点，就导致fast-forward合并。指向只是简单的移动，并生成一个新的提交
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否则就是一次真正的合并。默认把当前提交(ed489 如下所示)和另一个提交(33104)以及他们的共同祖父节点(b325c)进行一次三方合并。
结果是先保存当前目录和索引，然后和父节点33104一起做一次新提交。
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cherry Pick
cherry-pick命令"复制"一个提交节点并在当前分支做一次完全一样的新提交。
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rebase
衍合是合并命令的另一种选择。合并把两个父分支合并进行一次提交，提交历史不是线性的。衍合在当前分支上重演另一个分支的历史，提交历史是线性的。
本质上，这是线性化的自动的cherry-pick
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上面的命令都在topic分支中进行，而不是master分支，在master分支上重演，并且把分支指向新的节点。注意旧提交没有被引用，将被回收。
要限制回滚范围，使用--onto选项。下面的命令在master分支上重演当前分支从169a6以来的最近几个提交，即2c33a。
git-fsck --lost-found (file system check) 找回丢失的对象
Verifies the connectivity and validity of the objects in the database
找回丢失的对象: http://gitbook.liuhui998.com/5_9.html
git reflog : 分支等引用变更记录管理
Git reflog 机制 ： http://geeklu.com/2013/04/git-reflog/
注意:
rebase的含义是把当前分支的提交对象在目标分支上重做一遍，并生成了新的提交对象。
所以如果在master分支上需要对test分支进行rebase，你需要的命令是
git rebase master your-branch
这条命令等价于两条命令的合集
git checkout your-branch git rebase master
示例分析
假设team中有两个developer：tom和jerry，他们共同使用一个远程repo，并各自clone到自己的机器上，为了简化描述，这里假设只有一个branch：master。
这时tom机器的repo有两个branch master
origin/master
而jerry的机器上也是有两个branch master
origin/master
均如下图所示
tom和jerry分别各自开发自己的新feature，不断有新的commit提交到他们各自私有的commit history中，所以他们的master指针不断的向前推移，分别指向不同的commit。而又由于他们都没有git fetch和git push，所以他们的origin/master都维持不变。
jerry的repo如下
tom的repo如下，注意T1和上图的J1，分别是两个不同的commit
这时Tom首先把他的commit提交的远程repo中，那么他本机origin/master指针则会前进，和master指针保持一致，如下
远程repo如下
现在jerry也想把他的commit提交到远程repo上去，运行git push，毫无意外的失败了，所以他git fetch了一下，把远程repo，也就是之前tom提交的T1给拉到了他本机repo中，如下
commit history出现了分叉，要想把tom之前提交的内容包含到自己的工作中来，有一个方法就是git merge，它会自动生成一个commit，既包含tom的提交，也包含jerry的提交，这样就把两个分叉的commit重新又合并在一起。但是这个自动生成的commit会有两个parent，review代码的时候必须要比较两次，很不方便。
jerry为了保证commit history的线性，决定采用另外一种方法，就是git rebase。jerry的提交J1这时还没有被提交到远程repo上去，也就是他完全私有的一个commit，所以使用git rebase改写J1的history完全没有问题，改写之后，如下
注意J1被改写到T1后面了，变成了J1'
git push后，本机repo
而远程repo
异常的轻松，一条直线，没有-f
所以，想维持树的整洁，方法就是：在git push之前，先git fetch，再git rebase。
git fetch origin master
git rebase origin/master
git push
| HEAD | The current ref that you’re looking at. In most cases it’s probably refs/heads/master |
| FETCH_HEAD | The SHAs of branch/remote heads that were updated during the last git fetch |
| ORIG_HEAD | When doing a merge, this is the SHA of the branch you’re merging into |
| MERGE_HEAD | When doing a merge, this is the SHA of the branch you’re merging from |
| CHERRY_PICK_HEAD | When doing a cherry-pick, this is the SHA of the commit which you are cherry-picking |
参考：
[1] 【推荐】GIT & REPO & GERRIT : http://blog.csdn.net/edhroyal/article/details/9187727
[2] 【推荐】git-rebase : http://blog.yorkxin.org/posts/2011/07/29/git-rebase/
http://marklodato.github.io/visual-git-guide/index-zh-cn.html
master分支默认是公共分支，当有多人协同时，master分支在多个地方都有副本。
如果在master分支上执行git rebase test，会把master分支的提交历史进行修改，可以使用git log仔细观察rebase前后，master分支上的commit hash id。
一旦修改了master的commit hash id，而如果其他人已经基于之前的commit对象做了工作，那么当他拉取master的新的对象时，会需要再合并一次，这样反复下去，会把