中午试了很久aspera下载ncbi的数据,但是ncbi上的网址已经在2019年后不能用了
所以改成ena的网址,可以实现快速下载
将需要下载的文献在
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home
找到下载地址
整理成这样的格式:era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/srr/SRR154/002/SRR1542412
运行命令:
cat sra.txt | while read id
do
ascp -P33001 -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -v -l 200M -k 1 -T $id ./sra
done