摘要：
BioNet: an R-Package for the functional analysis of biological networks--文献解读 1.ABSTRACT Motivation: 随着转录组学和交互组学数据的数量和质量的不断增加，对网络分析的综合方法的需求不断增加。在这里，我们 阅读全文
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Inferring Pathway Activity toward Precise Disease Classification文献解读 Introduction Gene标记物的选择是通过对每个个体基因的表达模式在区分不同类型疾病或病例与对照组之间的能力进行评分。新患者的疾病状态是使用调整到标记基 阅读全文
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说明 核酸序列打分算法脚本,基于动态规划进行双序列全局比对,得到两条DNA序列的相似度并打分,但程序还有一些问题,在匹配长序列的时候还不够完善.(20年初写的放在简书上,这次copy到博客园,欢迎访问我的简书:https://www.jianshu.com/p/6bedaa9f6de1) 环境 Li 阅读全文
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对一般数据进行运算的常用函数： 数学函数：1、round() #四舍五入例：x <- c(3.1416, 15.377, 269.7)round(x, 0) #保留整数位round(x, 2) #保留两位小数round(x, -1) #保留到十位 2、signif() #取有效数字(跟学过的有效数字 阅读全文
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正交: 正交是线性代数的概念，是垂直这一直观概念的推广。作为一个形容词，只有在一个确定的内积空间中才有意义。若内积空间中两向量的内积为0，则称它们是正交的。如果能够定义向量间的夹角，则正交可以直观的理解为垂直。物理中：运动的独立性，也可以用正交来解释。 对于一般的希尔伯特空间， 也有内积的概念， 所 阅读全文
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#1.两数之和给定一个整数数组 nums 和一个目标值 target，请你在该数组中找出和为目标值的那 两个 整数，并返回他们的数组下标。# 你可以假设每种输入只会对应一个答案。但是，你不能重复利用这个数组中同样的元素。# 示例: 给定 nums = [2, 7, 11, 15], target = 9 因为 nums[0] + nums[1] = 2 + 7 = 9 # 所以返回 [0, 1]... 阅读全文
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做了基因组研究的summary,请各位大老帮忙看看，GCE评估180M(二倍体)，杂合率为0.0119/21kmer,用ALLPATH-LG的ErrorCorrectReads.pl进行评估83M(单倍体)，SNP率1/48,接着用canu进行组装，组装出165M的基因组，(1)直接进行Finish 阅读全文
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reportlab.canvas有这六个主要参数 1、pagesize：设置纸张大小 #from reportlab.lib.pagesizes import letter, A4 导入常见的页面大小库 # 2、bottomup：确定（0,0）点是不是在左下角 3、pageCompression：页 阅读全文
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使用方法： 效果： 阅读全文
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python的set和其他语言类似, 是一个无序不重复元素集, 基本功能包括关系测试和消除重复元素. 集合对象还支持union(联合), intersection(交), difference(差)和sysmmetric difference(对称差集)等数学运算. sets 支持 x in set, len(set),和 for x in set。作为一个无序的集合，sets不记录元... 阅读全文