每日学习记录20230220_tibble gseDO and limma
20230220:tibble gseDO and limma
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R的tibble格式数据需要转成dataframe才能去除格式,得到某一列纯粹的数据
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gseDO是DOSE包里面的函数,用于 Disease Ontology (DO) 分析和富集分析
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Q:为什么将FPKM转换为TPM去做转录组差异分析?
A:只有转换成TPM才勉强可以用limma做差异分析;而DESeq2和edgeR是对count数据进行差异分析