凯鲁嘎吉
用书写铭记日常,最迷人的不在远方

MATLAB实例:求相关系数、绘制热图并找到强相关对

作者:凯鲁嘎吉 - 博客园 http://www.cnblogs.com/kailugaji/

用MATLAB编程,求给定数据不同维度之间的相关系数,并绘制热图,保存图片,找到强相关的维度对。第3部分还给定相关系数,并自己DIY热力图颜色,给出实例。

数据集来自UCI中的wine:https://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Wine

1. demo.m

clear
clc
etea=0.8; %阈值
% 加载数据
data_load=dlmread('E:\scanplot\wine.data');
data=data_load(:,2:14);
[N, D]=size(data);
% 求维度之间的相关系数
rho = corr(data, 'type','pearson');
% 绘制热图
string_name={'Alcohol','Malic acid','Ash','Alcalinity of ash','Magnesium','Total phenols','Flavanoids','Nonflavanoid phenols','Proanthocyanins','Color intensity','Hue','Diluted wines','Proline'};
xvalues = string_name;
yvalues = string_name;
h = heatmap(xvalues,yvalues,rho, 'FontSize',10, 'FontName','Times New Roman');
h.Title = 'Correlation Coefficient';
colormap(jet)
saveas(gcf,sprintf('wine相关系数热图.jpg'),'bmp'); %保存图片
% 绝对值
rho=abs(rho);
rho_1=rho.*tril(ones(D,D),-1); %下三角
[row, col]=find(rho_1>etea); %找>etea的两个维度
[Num, ~]=size(row);
% A:存放相关系数>etea的两个维度及相关系数值
A=zeros(Num, 3);
for i=1:Num
    A(i,:)=[row(i), col(i), rho_1(row(i), col(i))];
    fprintf('强线性相关的两个维度是: 第%d个维度: %s与第%d个维度: %s, 两者的相关系数为:%f\n', row(i), string_name{row(i)}, col(i), string_name{col(i)}, rho_1(row(i), col(i)));    
end

2. 结果

>> demo
强线性相关的两个维度是: 第7个维度: Flavanoids与第6个维度: Total phenols, 两者的相关系数为:0.864564

3. 给定相关系数并自定义热力图颜色

% 自己给定相关系数,自己定义热力图颜色
% 作者:凯鲁嘎吉 - 博客园 http://www.cnblogs.com/kailugaji/
clear
clc
figure(1)
rho=[1.00 	0.16 	0.29 	0.05 	0.34 	0.41 	0.29 	0.22 	0.25 	0.56 	0.37 	0.19 	0.44 
0.16 	1.00 	0.44 	0.29 	0.13 	0.12 	0.19 	0.01 	0.26 	0.07 	0.00 	0.22 	0.05 
0.29 	0.44 	1.00 	0.08 	0.32 	0.35 	0.36 	0.20 	0.02 	0.27 	0.28 	0.44 	0.52 
0.05 	0.29 	0.08 	1.00 	0.21 	0.20 	0.26 	0.24 	0.20 	0.06 	0.07 	0.39 	0.21 
0.34 	0.13 	0.32 	0.21 	1.00 	0.86 	0.45 	0.61 	0.06 	0.43 	0.70 	0.50 	0.72 
0.41 	0.12 	0.35 	0.20 	0.86 	1.00 	0.54 	0.65 	0.17 	0.54 	0.79 	0.49 	0.85 
0.29 	0.19 	0.36 	0.26 	0.45 	0.54 	1.00 	0.37 	0.14 	0.26 	0.50 	0.31 	0.49 
0.22 	0.01 	0.20 	0.24 	0.61 	0.65 	0.37 	1.00 	0.03 	0.30 	0.52 	0.33 	0.50 
0.25 	0.26 	0.02 	0.20 	0.06 	0.17 	0.14 	0.03 	1.00 	0.52 	0.43 	0.32 	0.27 
0.56 	0.07 	0.27 	0.06 	0.43 	0.54 	0.26 	0.30 	0.52 	1.00 	0.57 	0.24 	0.62 
0.37 	0.00 	0.28 	0.07 	0.70 	0.79 	0.50 	0.52 	0.43 	0.57 	1.00 	0.31 	0.79 
0.19 	0.22 	0.44 	0.39 	0.50 	0.49 	0.31 	0.33 	0.32 	0.24 	0.31 	1.00 	0.63 
0.44 	0.05 	0.52 	0.21 	0.72 	0.85 	0.49 	0.50 	0.27 	0.62 	0.79 	0.63 	1.00 
]; %自己给定相关系数
% 绘制热图
string_name={'Alcohol','Malic acid','Ash','Alcalinity of ash','Magnesium','Total phenols','Flavanoids','Nonflavanoid phenols','Proanthocyanins','Color intensity','Hue','Diluted wines','Proline'};
xvalues = string_name;
yvalues = string_name;
h1 = heatmap(xvalues,yvalues, rho, 'FontSize',10, 'FontName','Times New Roman');
h1.Title = 'Correlation Coefficient';
% h1.ColorbarVisible = 'off';
map = [1 1 1; 1 1 0; 0.5 1 0.4; 0.2 0.85 0.2; 0.4 0.7 1; 0.2 0.5 0.8]; % 自己定义颜色
colormap(map)
% saveas(gcf,sprintf('wine相关系数热图_自定义.jpg'),'bmp'); %保存图片

MATLAB查看并设置当前颜色图:colormap

posted on 2019-11-19 19:52  凯鲁嘎吉  阅读(32892)  评论(5编辑  收藏  举报