fasta header 重命名
摘要
产生的fasta文件中的序列名(header),如果是重复的或者是没有意义的,就需要批量对其进行更改,针对不同目的,有不同的软件进行处理,seqtk的rename模块可以重命名重复的header;seqkit的replace模块可以完全自定义的重命名。
使用方法
# header前缀修改为21mer39t_,{nr}为第几个序列
seqkit replace -p .+ -r "21mer39t_{nr}" -j 120 -t dna -o 21mer_39times_dump_rename.fasta 21mer_39times_dump.fasta