AlphaFold结构组成

1.背景

AlphaFold预测蛋白结构

2.github链接

https://github.com/Urinx/alphafold_pytorch

3.项目分析

alphafold.sh 运行alphaFold.py程序

4.结构

　　<1> replica副本 0 1 2 3 指什么？

　　<2> mode DBT是什么意思

　　　  D - Distogram, B - Background, T - Torsion

4.工具

blast：序列比对

hhblits：蛋白质序列比对工具

plmDCA:

附录：

　　一、名词解释：

　　distogram 概率直方图

　　二、指令：

　　　　1.for i in {a..d} done

　　　　　　linux的指令 for对变量进行循环赋值 done表示linux命令的结束

　　　　2.f'{protein.targets.domain_name}.distance'

　　　　　　f在字符串的引号前，表示对其规范化，可以引用变量

　　　　3.shell的命令直接使用 $可以提出变量的值

　　　　　　eg:a=15   echo $a 

　　三、报错分析