spark-yarn模式和shuffle原理
sparkjob的部署 ----------------- 1.client driver run on client 2.cluster driver on a worker 4.启动job时,指定资源使用。 $>spark-submit --driver-memory MEM //设置driver内存,默认1g,配置2g --executor-memory MEM //控制每个执行器内存,默认1g [只在standalone模式下] --driver-cores //控制driver使用的内核数,默认1. [standalone & mesos] --total-executor-cores NUM //控制执行器使用的总内核数 [standalone & yarn] --executor-cores NUM //控制每个执行的内核数。 [yarn] --driver-cores NUM //控制driver内核数,默认1 --num-executors NUM //启动的执行器个数,动态分配内核启用时,数字就是Num的值。 5.启动spark-shell,手动分配资源 //启动3个executor,worker节点不能启动2个executor spark-shell --master spark://s101:7077 --driver-memory 2g --executor-memory 6g --total-executor-cores 4 --executor-cores 1 //启动了4个executor, spark-shell --master spark://s101:7077 --driver-memory 2g --executor-memory 3g --total-executor-cores 4 --executor-cores 1 //启动了7个executor, spark-shell --master spark://s101:7077 --driver-memory 2g --executor-memory 3g --total-executor-cores 22 --executor-cores 3 spark + yarn模式 -------------------- yarn模式,不需要spark集群,只是在client安装spark,提交作业时,走的是hadoop的流程。 使用spark的jar,在nodemanager上启动的spark的executor进程。 --master的值指定yarn即可,rm的地址从配置文件中提取的。 --master yarn --deployMode client //--master yarn-client --master yarn --deployMode cluster //--master yarn-cluster [yarn-client] Appmaster只运行appmaster自身程序,负责资源请求。 Driver仍然位于client执行。 [yarn-cluster] appmaster不但负责资源请求,还负责运行driver。 //实操 1.停止spark集群 stop-all.sh 2.启动zk和hdfs-yarn start-yarn.sh 3.配置spark的spark-env.sh的HADOOP_CONF_DIR并分发. ... export HADOOP_CONF_DIR=/soft/hadoop/etc/hadoop 4.启动spark-shell spark-shell --master yarn --deploy-mode client --num-executors 4 5.故障诊断 出现 is running beyond virtual memory limits. Current usage: 178.7 MB of 1 GB physical memory used; 2.3 GB of 2.1 GB virtual memory used. Killing container. 关闭yarn-site.xml虚拟内存检查并分发文件。 [yarn-site.xml] <property> <name>yarn.nodemanager.vmem-check-enabled</name> <value>false</value> </property> 6.spark yarn运行时将spark的所有jar上传到hdfs,协同hadoop的作业运行流程。 配置spark.yarn.jars或者spark.yarn.archive,避免每次上传jar包。 1.spark.yarn.jars spark.yarn.jars=hdfs:///some/path 2.spark.yarn.archive spark.yarn.archive=hdfs://mycluster/user/centos/spark/spark-jars.zip 3.配置spark.yarn.archive属性,避免每次上传大的jar包。 a)上传zip文件到hdfs://mycluster/user/centos/spark/spark-jars.zip b)配置spark配置文件。 [spark/conf/spark-default.conf] spark.yarn.archive hdfs://mycluster/user/centos/spark/spark-jars.zip c)启动shell $>spark-shell --master yarn-client ShuffleMapTask ------------------ private[spark] class ShuffleMapTask( stageId: Int, stageAttemptId: Int, taskBinary: Broadcast[Array[Byte]], //(rdd,dep) partition: Partition, @transient private var locs: Seq[TaskLocation], metrics: TaskMetrics, localProperties: Properties, jobId: Option[Int] = None, appId: Option[String] = None, appAttemptId: Option[String] = None) } shuffle管理 ------------------- [ShuffleManager] ShuffleManager,是shuffle系统可插拔接口。 ShuffleManager在driver和每个executor通过SparkEnv进行创建。 基于spark.shuffle.manager属性配置创建相应shuffleManager实现。 在spark 2.1.0中只有SortShuffleManager. 在spark 1.6.0中有SortShuffleManager和HashShuffleManager. [HashShuffleManager] spark.shuffle.consolidateFiles=true,默认false,合并输出。 slot = 并发能力 = 并发执行的线程数 = (执行器个数 * 每个执行器的cpu内核数) / 每个任务占用的内核数。 spark 2.1.0的实现类是SortShuffleManager(不论sort还是tungsten-sort(钨丝排序)) [SortShuffleManager] 基于排序的shuffle,输入kv按照目标分区的id进行排序,然后写入一个map输出文件。 reducer读取连续文件区域来提取数据。map内存不足,溢出到磁盘,磁盘上的文件最终输出到一个文件中。 该方式的shuffle有两种途径生成map输出文件: 1.串行化排序(以下三个条件均满足使用) a)shuffle依赖没有指定聚合或者输出排序 b)shuffle序列化器支持序列化值得重新定位。(当前只有KryoSerializer和SQL的Serializer可以,java不可以) c)shuffle生成的分区少于16777216个. 2.反串行排序 所有其他情况。 [串行化排序模式] 该模式下,传递给ShuffleWriter的record即可被串行化,排序时也是串行化进行缓冲。该方式有几点优化 处理: 1.对串行化的二进制数据进行排序,而不是针对java对象,因此可以减少内存消耗和过度GC。 该优化机制要求串行化器具有特殊的属性能够对串行的record进行重排序,不需要反串过程。 2.使用串行化的具有高效缓存特征的sorter,可以对压缩的record指针和分区id的数组进行排序。 数组中,每条record使用8字节空间存储。 3.溢出合并过程对串行化的数据块(属于同一分区)进行操作,并且合并期间不需要反串(流)。 4.支持压缩文件块的合成,合并过程简单的将压缩和串行化的分区最终合并成一个分区文件, 支持高效数据复制方式,例如NIO中的零拷贝。 ShuffleManager.registerShuffle() ----------------------------------- //1.通过ShuffleDep判断是否需要bypass if (SortShuffleWriter.shouldBypassMergeSort(SparkEnv.get.conf, dependency)) { new BypassMergeSortShuffleHandle[K, V](shuffleId, numMaps, dependency.asInstanceOf[ShuffleDependency[K, V, V]]) } //判断依赖是否可以串行shuffle else if (SortShuffleManager.canUseSerializedShuffle(dependency)) { new SerializedShuffleHandle[K, V]( shuffleId, numMaps, dependency.asInstanceOf[ShuffleDependency[K, V, V]]) } //基本shuffle else { new BaseShuffleHandle(shuffleId, numMaps, dependency) } 是否迂回的条件 ------------------------- def shouldBypassMergeSort(conf: SparkConf, dep: ShuffleDependency[_, _, _]): Boolean = { //如果map端需要聚合,不能回调。 if (dep.mapSideCombine) { require(dep.aggregator.isDefined, "Map-side combine without Aggregator specified!") false } //判断依赖的分区数量是否小于指定的配置(默认时200) else { val bypassMergeThreshold: Int = conf.getInt("spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold", 200) dep.partitioner.numPartitions <= bypassMergeThreshold } } //结论 if(map需要聚合){ //不能迂回 } else{ if(分区数 <= 200(可配:spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold)){ //可以迂回 } else{ //不能迂回 } } 串行shuffle的判断条件 ------------------------ def canUseSerializedShuffle(dependency: ShuffleDependency[_, _, _]): Boolean = { val shufId = dependency.shuffleId val numPartitions = dependency.partitioner.numPartitions //判断是否dep中使用的串行化器是否时kryo(kryo支持)。 if (!dependency.serializer.supportsRelocationOfSerializedObjects) { false } //判断dep是否定义聚合器 else if (dependency.aggregator.isDefined) { false } //分区数大于特定值 else if (numPartitions > MAX_SHUFFLE_OUTPUT_PARTITIONS_FOR_SERIALIZED_MODE) { false } /// else { true } } //结论 if(不是kryo){ //不能用串行shuffle } // else if(dep定义了聚合器){ //不能用串行shuffle } else if(分区数 > (1 << 24) ){ //不能用串行shuffle } else{ //使用串行shuffle } 整个shuffle处理手段的优先级 --------------------------- //1.迂回策略 if(能否迂回){ //new BypassMergeSortShuffleHandle() } //2.串行策略 else if(是否串行){ //new SerializedShuffleHandle(); } //3.常规策略 else{ //new BaseShuffleHandle } SortShuffleManager.getWrtier() -------------------------------- handle match{ case SerializedShuffleHandle => new UnsafeShuffleWriter(); case BypassMergeSortShuffleHandle => new BypassMergeSortShuffleWriter(); case BaseShuffleHandle => new SortShuffleWriter(); } ShuffleWriter的特性 -------------------- abstract class ShuffleWriter | / \ --- | |------BypassMergeSortShuffleWriter |------UnsafeShuffleWriter |------SortShuffleWriter [BypassMergeSortShuffleWriter] 该类实现了hash方式的shuffle处理手段,将record写入单独文件,每个分区一个文件。 然后对每个分区文件合并再产生一个文件,文件的不同区域用于不同reduce,该模式下, record不在内存中缓存,这是和HashShuffleWriter本质不同点。 该方式对于有大量分区的shuffle处理效率不高,原因是需要对所有分区同时打开串行化器 和文件流。 [UnsafeShuffleWriter] 将kv分开单独以kryo串行写入缓冲区,然后将缓冲放入ShuffleExternalSorter中。 1.ShuffleExternalSorter 专门用于基于sort的shuffle。record追加到date page,如果所有record插入 后或者内存到达limit值,这些记录按照分区id进行排序,排序后的记录写入单独 的输出文件(或多个文件),输出文件的格式和SortShuffleWriter输出文件格式相同, 每条分区的记录都是单独串行和压缩写入的,同样使用反串和解压缩方式读取。 和ExternalSorter不同,该对象不对溢出文件进行合并,而是将合并过程交给 UnsafeShuffleWriter,避免多余串行和反串过程。 KV以串行和压缩方式写缓冲区,再将缓冲区字节数组写入页面内存(long[]),标记好 长度、偏移量、分区数等等,每个KV在页面内存的地址和分区进行编码后写入内存 排序器(InMemorySorter,该排序器使用分区id降序排列).如果内存页默认超过1G( 可以通过spark.shuffle.spill.numElementsForceSpillThreshold进行修改)个kv, 发生溢出,进行排序输出到文件。 [SortShuffleWriter] Spark中的串行化 ------------------- spark默认使用java串行化器,但性能一般,优化手段之一 使用kryo串行化,但是kryo串行化器对于要串行化的类使用前 需要注册,spark的kryo串行化器只是对java内置类、scala的内置 类核spark的内置类进行了注册,自定义的类必须手动注册。 也是没有把kryo串行化器做为默认设置的原因. keyo串行化为什么快 —————————————————————————————————————————— 为什么kryo比其它的序列化方案要快? 为每一个类分配一个id 实现了自己的IntMap 代码中一些取巧的地方: 利用变量memoizedRegistration和memoizedType记录上一次的调用writeObject函数的Class,则如果两次写入同一类型时,可以直接拿到,不再查找HashMap。