摘要: 生物信息学原理作业第四弹:DNA序列组装(非循环子图) 原理:生物信息学(孙啸) 大致思想: 1. 这个算法理解细节理解比较困难,建议看孙啸的生物信息学相关章节。 2. 算法要求所有序列覆盖整个目标DNA,并保证相邻片段有足够的覆盖连接(引自孙啸 生物信息学)。 3. 最后推导出符合条件的序列构成的 阅读全文
posted @ 2017-12-04 21:49 orange1002 阅读(1676) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 生物信息学原理作业第四弹:DNA序列组装(贪婪算法) 原理:生物信息学(孙啸) 大致思想: 1. 找到权值最大的边; 2. 除去以最大权值边的起始顶点为起始顶点的边; 3. 除去以最大权值边为终点为终点的边; 4. 重复上述步骤,得到所有符合条件的边; 5. 拼接得到的边; 6. 加入孤立点(如果有 阅读全文
posted @ 2017-12-04 21:33 orange1002 阅读(2400) 评论(4) 推荐(1) 编辑