代谢组学分析

综述文章
标准数据
流程样例 & 实用工具
- MetaboAnalyst的多组学分析
- 程序

综述文章

【代谢组学】3.数据分析
https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/12116920.html

【代谢组学】4.生物标志物分析
https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/12142441.html

非靶向代谢组学数据分析方法总结
https://blog.csdn.net/fjsd155/article/details/89685075

标准数据

流程样例 & 实用工具

质谱原始数据出发，进行峰对齐、保留时间校正和峰面积提取。代谢物结构鉴定采用精确质量数匹配（<25 ppm）和二级谱图匹配的方式，检索METLIN数据库和 HMDB 数据库；两组比较时，删除两组组内缺失值均>50%的离子峰；接着对数据进行归一化（采用 autoscaling或UV法）。百泰派克应用 MetaboAnalysis、SIMCA-P软件进行多维统计分析和单维统计分析，包括PCA、PLS-DA、OPLS-DA、以及通路富集分析，确保提供全面精准的代谢组学分析结果。