摘要: LAMMPS 即 Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator (大规模原子分子并行模拟器),是由美国能源部桑迪亚国家实验室开发的一种开源的经典分子动力学模拟代码 in 文件描述一个符合牛顿定律的模拟过程,内容大致包含三个部分: 阅读全文
posted @ 2019-01-07 20:33 Bree-No1 阅读(9116) 评论(3) 推荐(0) 编辑
摘要: .Download 1.American Mineralogist Crystall Structure Database : http://rruff.geo.arizona.edu/AMS/amcsd.php 下载AMC文件——导入Vesta,导出VMD支持文件,如pdb文件——导入VMD三种方 阅读全文
posted @ 2019-01-07 20:30 Bree-No1 阅读(5658) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 一.data文件的生成 1.XX.data.file 2.选定位置生成data文件,Tk控制台命令如下:topo writelammpsdata XX.data #此生成的data文件不包含键能,键长,键角的信息,需要自己参考文献,手动输入。 #在使用时加入-ignore参数就可以自己输入了。 阅读全文
posted @ 2019-01-07 20:27 Bree-No1 阅读(3497) 评论(0) 推荐(0) 编辑