2016年12月25日
GATK read_filter参数解释
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posted @ 2016-12-25 16:12 zkkaka 阅读(11) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2016年12月23日
picard中PCR duplication报错
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posted @ 2016-12-23 14:43 zkkaka 阅读(2) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2016年12月22日
Picard报错“MAPQ should be 0 for unmapped read”的解决方法
摘要： picard对bwa生成的sam文件进行reorder时，报错如下： Getting Help Exception in thread "main" htsjdk.samtools. SAM Format Exception: Error parsing text SAM file. MAPQ sh 阅读全文
posted @ 2016-12-22 16:52 zkkaka 阅读(808) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2016年12月19日
转：cutadapt基础用法
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posted @ 2016-12-19 16:11 zkkaka 阅读(8) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2016年12月13日
转： bowtie2 简单使用
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posted @ 2016-12-13 15:22 zkkaka 阅读(8) 评论(0) 推荐(0) 编辑
转：bowtie2
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posted @ 2016-12-13 09:36 zkkaka 阅读(10) 评论(0) 推荐(0) 编辑
转：整合GWAS和WGCNA分析挖掘数量性状的微效作用位点
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posted @ 2016-12-13 08:59 zkkaka 阅读(24) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2016年12月12日
转：GATK使用方法详解（包含bwa使用）（四）
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posted @ 2016-12-12 16:22 zkkaka 阅读(24) 评论(0) 推荐(0) 编辑
转：GATK使用方法详解（包含bwa使用）（三）
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posted @ 2016-12-12 15:48 zkkaka 阅读(24) 评论(0) 推荐(0) 编辑
转：GATK使用方法详解（包含bwa使用）（二）
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posted @ 2016-12-12 15:46 zkkaka 阅读(31) 评论(0) 推荐(0) 编辑