Spark常见的问题以及解决方案

Spark为什么比Hadoop要快？

Spark比hadoop快的原因，我认为主要是spark的DAG机制优于hadoop太多，spark的DAG机制以及RDD的设计避免了很多落盘的操作，在窄依赖的情况下可以在内存中完成end to end的计算，相比于hadoop的map reduce编程模型来说，少了很多IO的开销。其次还有几个其他方面的助攻

  1. shuffl机制的不同
    虽然2者都会遇到shuffle的场景，但是spark的shuffle更加先进。对于MapReduce，其在Shuffle时需要花费大量时间进行排序，排序在MapReduce的Shuffle中似乎是不可避免的。而spark在shuffle的时候，不一定会用到排序，有可能会使用Hash的形式
  2. mr是多进程，spark则是多线程
    线程相比于进程，少了很多CPU调度下的资源切换。

spark的shfflue机制

上面说到spark比mr优越的一个原因也是shffle机制的不同。具体来说，spark的shffle机制从它诞生到现在一共有这么几种。
shuffle的意思就是打乱数据顺序使得相同的key被统一到同一个分区。

spark中只有2类stage：ShuffleMapStage和ResultStage。但其总的过程包含有map阶段(shuffle write)和reduce阶段(shuffle read)，两个阶段位于不同的stage中。
ResultStage基本上对应代码中的action算子, 而ShuffleMapStage 的则伴随着 shuffle IO。spark的mr和hadoop的mapreduce不是一个东西。map端task和reduce端task不在相同的stage中，map task位于ShuffleMapStage，reduce task位于ResultStage。map task会先执行，将上一个stage得到的最后结果写出，后执行的reduce task拉取上一个stage进行合并。
对于一次shuffle，map过程和reduce过程都有若干个task来执行。对于task的个数，map端的task个数和RDD的partition个数相同，reduce 端的 stage 默认取spark.default.parallelism 这个配置项的值作为分区数，如果没有配置，则以 map 端的最后一个 RDD 的分区数作为其分区数，分区数就将决定 reduce 端的 task 的个数。
在Spark的源码中，负责shuffle过程的执行、计算和处理的组件主要就是ShuffleManager。

spark1.2

在Spark 1.2以前，默认的shuffle计算引擎是HashShuffleManager。它的计算模式比较的简单粗暴，详细如下：

  • shuffle write阶段

这个阶段将stage中每个task处理的数据根据算子进行“划分”。比如reduceByKey，就是对相同的key执行hash算法，从而将相同都写入同一个磁盘文件中，而每一个磁盘文件都只属于下游stage的一个task。在将数据写入磁盘之前，会先将数据写入内存缓冲中，当内存缓冲填满之后，才会溢写到磁盘文件中去。

  • shuffle read阶段

stage的每一个task就需要将上一个stage的计算结果中的所有相同key，从各个节点上通过网络都拉取到自己所在的节点上，然后进行key的聚合或连接等操作。由于shuffle write的过程中，task给下游stage的每个task都创建了一个磁盘文件，因此shuffle read的过程中，每个task只要从上游stage的所有task所在节点上，拉取属于自己的那一个磁盘文件即可。

那么针对这种简单粗暴的HashShuffleManager，有着一个非常严重的弊端：会产生大量的中间磁盘文件，这样大量的磁盘IO操作会很影响性能。磁盘文件的数量由下一个stage的task数量决定，即下一个stage的task有多少个，当前stage的每个task就要创建多少份磁盘文件。比如下一个 stage 总共有 100 个 task，那么当前 stage 的每个 task 都要创建 100 份磁盘文件，如果当前stage有50个 task，那么总共会建立5000个磁盘文件。

优化之后的HashShuffleManager

由于原版的HashShuffleManager，HashShuffleManager后期进行了优化，这里说的优化是指可以设置一个参数，
spark.shuffle.consolidateFiles=true。该参数默认值为false，通常来说如果我们使用HashShuffleManager，那么都建议开启这个选项。开启consolidate机制之后，在shuffle write过程中，task不会为下游stage的每个task创建一个磁盘文件，此时会出现shuffleFileGroup的概念，每个 shuffleFileGroup会对应一批磁盘文件，磁盘文件的数量与下游stage的task数量是相同的。而此时就会根据Executor数，并行执行task。第一批并行执行的每个task都会创建一个shuffleFileGroup，并将数据写入对应的磁盘文件内。当Executor执行完一批task，接着执行下一批task时，下一批task就会复用之前已有的shuffleFileGroup，将数据写入已有的磁盘文件中，而不会写入新的磁盘文件中。即运行在同一个Executor的task会复用之前的磁盘文件。 这样就可以有效将多个task的磁盘文件进行一定程度上的合并，从而大幅度减少磁盘文件的数量，进而提升shuffle write的性能。

当前spark默认使用的SortShuffleManager

在Spark 1.2以后的版本中，默认的ShuffleManager改成了SortShuffleManager。SortShuffleManager的运行机制主要分成两种，一种是普通运行机制，另一种是bypass运行机制。当shuffle read task的数量小于等于spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold参数的值时（默认为200），就会启用bypass机制。

普通运行模式

在普通模式下，数据会先写入一个内存数据结构中，此时根据不同的shuffle算子，可以选用不同的数据结构。如果是由聚合操作的shuffle算子，就是用map的数据结构（边聚合边写入内存），如果是join的算子，就使用array的数据结构（直接写入内存）。等到内存容量到了临界值就准备溢写到磁盘。在溢写到磁盘文件之前，会先根据key对内存数据结构中已有的数据进行排序，排序之后，会分批将数据写入磁盘文件，每批次默认1万条数据。此时task往磁盘溢写，会产生多个临时文件，最后会将所有的临时文件都进行合并，合并成一个大文件。最终只剩下两个文件，一个是合并之后的数据文件，一个是索引文件，标识了下游各个task的数据在文件中的start offset与end offset。下游的task根据索引文件读取相应的数据文件。需要注意的是，此处所说的两个文件，是指上游一个task生成两个文件，而非所有的task最终只有两个文件。

bypass机制

触发bypass机制的条件：

  • shuffle map task的数量小于spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold参数的值（默认200）
  • 不是聚合类的shuffle算子（比如groupByKey）
    排序的时间复杂度最高不能优于O(nlogn)，那么如果将排序的时间复杂度省下，那么shuffle性能将会提升很多。bypass机制与普通SortShuffleManager运行机制的不同在于，bypass机制就是利用了hash的O(1)时间复杂度取代了排序的操作开销，提升了这部分的性能。
    ​task会为每个下游task都创建一个临时磁盘文件，并将数据按key进行hash然后根据key的hash值，将key写入对应的磁盘文件之中。如上，写入磁盘文件时也是先写入内存缓冲，缓冲写满之后再溢写到磁盘文件的。最后，同样会将所有临时磁盘文件都合并成一个磁盘文件，并创建一个单独的索引文件。

针对shuffle机制的调优策略

  • spark.shuffle.file.buffer

该参数用于设置shuffle write task的BufferedOutputStream的buffer缓冲大小（默认是32K）。将数据写到磁盘文件之前，会先写入buffer缓冲中，待缓冲写满之后，才会溢写到磁盘。
如果作业可用的内存资源较为充足的话，可以适当增加这个参数的大小（比如64k），从而减少shuffle write过程中溢写磁盘文件的次数，也就可以减少磁盘IO次数，进而提升性能。在实践中发现，合理调节该参数。

  • spark.reducer.maxSizeInFlight：

该参数用于设置shuffle read task的buffer缓冲大小，而这个buffer缓冲决定了每次能够拉取多少数据。如果作业可用的内存资源较为充足的话，可以适当增加这个参数的大小（比如96m），从而减少拉取数据的次数，也就可以减少网络传输的次数，进而提升性能。

  • spark.shuffle.io.maxRetries & spark.shuffle.io.retryWait：

spark.shuffle.io.retryWait：huffle read task从shuffle write task所在节点拉取属于自己的数据时，如果因为网络异常导致拉取失败，是会自动进行重试的。该参数就代表了可以重试的最大次数。（默认是3次）
spark.shuffle.io.retryWait：该参数代表了每次重试拉取数据的等待间隔。（默认为5s）
一般的调优都是将重试次数调高，不调整时间间隔。

  • spark.shuffle.memoryFraction：

该参数代表了Executor内存中，分配给shuffle read task进行聚合操作的内存比例。

  • spark.shuffle.manager

该参数用于设置shufflemanager的类型（默认为sort）。Spark1.5x以后有三个可选项：
Hash：spark1.x版本的默认值，HashShuffleManager
Sort：spark2.x版本的默认值，普通机制，当shuffle read task 的数量小于等于spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold参数，自动开启bypass 机制
tungsten-sort：
复制代码spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold
参数说明：当ShuffleManager为SortShuffleManager时，如果shuffle read task的数量小于这个阈值（默认是200），则shuffle write过程中不会进行排序操作。
调优建议：当你使用SortShuffleManager时，如果的确不需要排序操作，那么建议将这个参数调大一些

  • spark.shuffle.consolidateFiles：

如果使用HashShuffleManager，该参数有效。如果设置为true，那么就会开启consolidate机制，也就是开启优化后的HashShuffleManager。
如果的确不需要SortShuffleManager的排序机制，那么除了使用bypass机制，还可以尝试将spark.shffle.manager参数手动指定为hash，使用HashShuffleManager，同时开启consolidate机制。在实践中尝试过，发现其性能比开启了bypass机制的SortShuffleManager要高出10%~30%。

Spark基石--RDD

RDD又叫弹性分布式数据集，表示一个只读的包含多个并行分区的集合。其中

  • 弹性意味着：当计算过程中内存不足时可刷写到磁盘等外存上，可与外存做灵活的数据交换
  • 分布式：分区使得可以在多个机器上并行计算
  • 一组只读的、可分区的分布式数据集合，集合内包含了多个分区
    一个最简单的rdd至少要包含以下几个东西，这些都被定义在spark core组件的rdd的抽象类中
  • 一组分区
  • 定义在这个分区上的操作
  • 当前rdd和其他rdd的依赖
    可选的有
  • Preferred Location

是一个列表，用于存储每个 Partition 的优先位置。对于每个 HDFS 文件来说，这个列表保存的是每个 Partition 所在的块的位置，也就是该文件的「划分点」

  • 分区方式

RDD 的分区方式主要包含两种：Hash Partitioner 和 Range Partitioner，这两种分区类型都是针对 Key-Value 类型的数据，如是非 Key-Value 类型则分区函数为 None。Hash 是以 Key 作为分区条件的散列分布，分区数据不连续，极端情况也可能散列到少数几个分区上导致数据不均等；Range 按 Key 的排序平衡分布，分区内数据连续，大小也相对均等。

那么我们把rdd画出来之后它大概是这个样子

图所示是 RDD 的内部结构图，它是一个只读、有属性的数据集。它的属性用来描述当前数据集的状态。
数据集data由数据的分区（partition）组成，并由（block）映射成真实数据。
RDD 的主要属性可以分为 3 类：与上述图中代码对应，细节上来说主要有：

    1. 与其他 RDD 的关系（parents、dependencies）
    1. 数据(partitioner、checkpoint、storage level、iterator 等)
    1. RDD 自身属性(sparkcontext、sparkconf)

RDD 自身属性

从自身属性说起，自身属性包含spark上下文，以及初始化sc时候的配置信息conf
SparkContext 是 Spark job 的入口，由 Driver 创建在 client 端, 并向集群资源管理器如yarn等申请资源这些都是由sc完成
conf就是我们设置的一些job参数

数据集list

RDD 内部的数据集合在逻辑上和物理上被划分成多个小子集合，这样的每一个子集合我们将其称为分区（Partitions），分区的个数会决定并行计算的粒度，有多少分区就有多少的task，而每一个分区数值的计算都是在一个单独的任务中进行的，因此并行任务的个数也是由 RDD分区的个数决定的。但事实上 RDD 只是数据集的抽象，分区内部并不会存储具体的数据。Partition 类内包含一个 index 成员，表示该分区在 RDD 内的编号，通过 RDD 编号+分区编号可以确定该分区对应的唯一块编号，再利用底层数据存储层提供的接口就能从存储介质（如：HDFS、Memory）中提取出分区对应的数据。

RDD 的分区方式主要包含两种：Hash Partitioner 和 Range Partitioner，这两种分区类型都是针对 Key-Value 类型的数据，如是非 Key-Value 类型则分区函数为 None。Hash 是以 Key 作为分区条件的散列分布，分区数据不连续，极端情况也可能散列到少数几个分区上导致数据不均等；Range 按 Key 的排序平衡分布，分区内数据连续，大小也相对均等。
Preferred Location 是一个列表，用于存储每个 Partition 的优先位置。对于每个 HDFS 文件来说，这个列表保存的是每个 Partition 所在的块的位置，也就是该文件的「划分点」。

Storage Level 是 RDD 持久化的存储级别，RDD 持久化可以调用两种方法：cache 和 persist：persist 方法可以自由的设置存储级别，默认是持久化到内存；cache 方法是将 RDD 持久化到内存，cache 的内部实际上是调用了persist 方法，由于没有开放存储级别的参数设置，所以是直接持久化到内存。

checkpoint

Checkpoint 是 Spark 提供的一种缓存机制，当需要计算依赖链非常长又想避免重新计算之前的 RDD 时，可以对 RDD 做 Checkpoint 处理，检查 RDD 是否被物化或计算，并将结果持久化到磁盘或 HDFS 内。Checkpoint 会把当前 RDD 保存到一个目录，要触发 action 操作的时候它才会执行。在 Checkpoint 应该先做持久化（persist 或者 cache）操作，否则就要重新计算一遍。若某个 RDD 成功执行 checkpoint，它前面的所有依赖链会被销毁。
与 Spark 提供的另一种缓存机制 cache 相比：cache 缓存数据由 executor 管理，若 executor 消失，它的数据将被清除，RDD 需要重新计算；而 checkpoint 将数据保存到磁盘或 HDFS 内，job 可以从 checkpoint 点继续计算。Spark 提供了 rdd.persist(StorageLevel.DISK_ONLY) 这样的方法，相当于 cache 到磁盘上，这样可以使 RDD 第一次被计算得到时就存储到磁盘上，它们之间的区别在于：persist 虽然可以将 RDD 的 partition 持久化到磁盘，但一旦作业执行结束，被 cache 到磁盘上的 RDD 会被清空；而 checkpoint 将 RDD 持久化到 HDFS 或本地文件夹，如果不被手动 remove 掉，是一直存在的。

spark血统

一个作业从开始到结束的计算过程中产生了多个 RDD，RDD 之间是彼此相互依赖的，我们把这种父子依赖的关系称之为「血统」。RDD 只支持粗颗粒变换，即只记录单个块（分区）上执行的单个操作，然后创建某个 RDD 的变换序列（血统 lineage）存储下来。
变换序列指每个 RDD 都包含了它是如何由其他 RDD 变换过来的以及如何重建某一块数据的信息。因此 RDD 的容错机制又称「血统」容错。 要实现这种「血统」容错机制，最大的难题就是如何表达父 RDD 和子 RDD 之间的依赖关系。

分区机制

RDD 的分区机制有两个关键点：一个是关键参数，即 Spark 的默认并发数 spark.default.parallelism；另一个是关键原则，RDD 分区尽可能使得分区的个数等于集群核心数目。
设置的时候可以在spark conf下设置

  • spark.default.parallelism
  • 或者在rdd转换的时候做repartition

RDD常用操作/算子

action算子

transform算子

spark 数据倾斜问题的处理方案

数据倾斜也是我们经常遇到的问题之一，那么通常情况下，判断spark数据倾斜的方法有2个

  1. client模式下，会有“进度条”，会显示当前位于那个stage，以及当前stage的task数量，当进度条突然变得很慢的时候，或者卡在某个stage不动的话，一般都是出现了数据倾斜（很少会出现资源被占）
  2. spark UI: 从spark ui中可以看出每个task处理的数据量和消耗的时间

数据倾斜发生的原因

数据倾斜的原理很简单：在进行shuffle的时候，必须将各个节点上相同的key拉取到某个节点上的一个task来进行处理，比如按照key进行聚合或join等操作。此时如果某个key对应的数据量特别大的话，就会发生数据倾斜。比如大部分key对应10条数据，但是个别key却对应了100万条数据，那么大部分task可能就只会分配到10条数据，然后1秒钟就运行完了；但是个别task可能分配到了100万数据，要运行一两个小时。因此，整个Spark作业的运行进度是由运行时间最长的那个task决定的。
因此出现数据倾斜的时候，Spark作业看起来会运行得非常缓慢，甚至可能因为某个task处理的数据量过大导致内存溢出。
下图就是一个很清晰的例子：

hello这个key，在三个节点上对应了总共7条数据，这些数据都会被拉取到同一个task中进行处理；而world和you这两个key分别才对应1条数据，所以另外两个task只要分别处理1条数据即可。此时第一个task的运行时间可能是另外两个task的7倍，而整个stage的运行速度也由运行最慢的那个task所决定。

那么面对数据倾斜大概有如下几个方案

map侧代替join侧

小表join大表，如果小表能够被存储在work的内存中的话，通过Spark的Broadcast机制，将Reduce侧Join转化为Map侧Join，避免Shuffle, 整个流程从宽依赖转变为窄依赖，从而完全消除Shuffle带来的数据。

随机前缀后缀key

为数据量特别大的Key增加随机前/后缀，使得原来Key相同的数据变为Key不相同的数据，从而使倾斜的数据集分散到不同的Task中，彻底解决数据倾斜问题。Join另一则的数据中，与倾斜Key对应的部分数据，与随机前缀集作笛卡尔乘积，从而保证无论数据倾斜侧倾斜Key如何加前缀，都能与之正常Join。

增加task的并行度

也可以被称为提高shfflue操作的并行度，在对RDD执行shuffle算子时，给shuffle算子传入一个参数，比如reduceByKey(1000)，该参数就设置了这个shuffle算子执行时shuffle read task的数量。对于Spark SQL中的shuffle类语句，比如group by、join等，需要设置一个参数，即spark.sql.shuffle.partitions，该参数代表了shuffle read task的并行度，该值默认是200
增加shuffle read task的数量，可以让原本分配给一个task的多个key分配给多个task，从而让每个task处理比原来更少的数据。举例来说，如果原本有5个key，每个key对应10条数据，这5个key都是分配给一个task的，那么这个task就要处理50条数据。而增加了shuffle read task以后，每个task就分配到一个key，即每个task就处理10条数据，那么自然每个task的执行时间都会变短了。具体原理如下图所示。

参考文献或转载
shfflue机制 https://juejin.im/post/6844904099872243719
spark rdd
[数据倾斜1](http://www.jasongj.com/spark/skew/, https://blog.csdn.net/u012501054/article/details/101371050)

posted @ 2020-08-26 00:56  real-zhouyc  阅读(1469)  评论(0)  编辑  收藏  举报