摘要： 1 rdfrdf又称g( r )，rdf的计算与输出通过以下命令计算输出： compute ID group-ID rdf Nbin itype1 jtype1 itype2 jtype2 ...fix ID group-ID ave/time Nevery Nrepeat Nfreq value1 阅读全文

摘要： 无论任何模拟，我们都是想从模拟中得到我们想要的数据【data】，然后分析这些数据，从而提取出相关的信息【MAYBE新的发现】，那么数据的输出是必然的一道程序，下面谈谈LAMMPS软件是如何输出data。LAMMPS中处理的输出数据主要分一下三个大的部分：1.断点数据，这个主要是为了防止模拟过程中出现 阅读全文

摘要： 语法： fix ID group-ID style_name keyword value ... ID 是fix名，group-ID是fix所作用的群组名。这两个是所有fix命令都需要的。 style_name可以选择NVT、NPT或者NPH 关键词keyword和对应的数值value可以添加 ke 阅读全文

摘要： 题目中涉及到模拟技巧问题，一般模拟的时候，我们都会设置断点的。有的软件自动设置断点，比如GROMACS就有断点设置。而LAMMPS不是自动设置的，需要大家在in文件中写明。下面讲讲如何设置断点： 常用的方法，而且是强烈推荐的方法是用restart命令，放置在run命令的前面。 1. 格式是：rest 阅读全文

摘要： “模量”可以理解为是一种标准量或指标。材料的“模量”一般前面要加说明语，如弹性模量、压缩模量、剪切模量、截面模量等。这些都是与变形有关的一种指标。 杨氏模量(Young's Modulus)： 杨氏模量就是弹性模量,这是材料力学里的一个概念。对于线弹性材料有公式σ(正应力)＝Eε(正应变)成立，式中 阅读全文

摘要： Linux常用命令大全 系统信息 arch 显示机器的处理器架构uname -m 显示机器的处理器架构uname -r 显示正在使用的内核版本 dmidecode -q 显示硬件系统部件 - (SMBIOS / DMI) hdparm -i /dev/hda 罗列一个磁盘的架构特性 hdparm - 阅读全文

摘要： lammps能量单位换算（转载） 转自：https://www.cnblogs.com/Simulation-Campus/p/8823291.html 1 electron-volt [eV] = 11604.5250061657 kelvin [K] https://www.translator 阅读全文

摘要： in文件注意事项及详细解释（转载） 转载自:https://www.cnblogs.com/sysu/p/10817315.html 和 https://www.cnblogs.com/panscience/p/4953940.html lammps做分子动力学模拟时，需要一个输入文件（input 阅读全文

摘要： 为一组原子施加fix约束。在LAMMPS中，fix是施加在分子动力学时间步或能量最小化过程中的某种操作。举例来说，它可能是在时间积分的过程中更新原子的位置和速度，或是控制温度，或是给原子施加约束力，或是强制某种边界条件，或计算过程诊断，等等。在LAMMSP中有一些列可以使用的fix命令，具体参考后面的列表。 阅读全文