摘要: 本地安装Cuda版本的Torch 之前安装了Torch,但是是CPU版本的,对于模型训练而言cpu版本的Torch实在是太慢了,所以开始安装Cuda(GPU)版本的torch。 推荐下载站:上海交通大学镜像 为什么要本地安装Torch 由于现在国内直接安装Torch还是太慢了,主要是国内直连国外的服 阅读全文
posted @ 2021-08-22 16:56 一只小小郑 阅读(1494) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 使用sort完成基因组注释信息或bed文件的排序 https://www.jieandze1314.com/post/cnposts/114/ 阅读全文
posted @ 2021-08-19 19:59 一只小小郑 阅读(58) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: ##Samtools pick up seq # grep the name of gene and find the real name in goat_reference_gene_list for record in `grep "Re" ../out_No_Pinneped`; do gre 阅读全文
posted @ 2021-07-23 15:59 一只小小郑 阅读(50) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Ryzen系列APU需要扩大专用核显显存吗? 之前看到很多的blog中间说到 APU对于专用显存并没有太高的要求,很多的厂家专门分出了1G显存给锐龙核显,使得本就捉襟见肘的8G内存只剩下了7G。 关于这一点,我是同意的,在8G的状态下,很多的厂家居然能把1G内存直接干没了,实在是不合适。 但是如果内 阅读全文
posted @ 2021-07-19 14:38 一只小小郑 阅读(2285) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: NVME硬盘和Sata硬盘的区别 实际上NVME硬盘和Sata硬盘只是接口的区别,最开始的机械硬盘也是用的Sata协议。Sata协议一般来说可能只能到600Mbps的带宽,但是早期的机械硬盘别说600Mbps,可能连300Mbps都没有。而且随机读写性能实际上非常的差,可能连基本的小文件读写都不能满 阅读全文
posted @ 2021-05-31 13:42 一只小小郑 阅读(1122) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 为什么你需要perl版本的rename? 因为CentOS自带的rename是C版本的,并不支持简单的Regualr expression。(似乎和mv没有本质的区别吧 =( 如何为自己安装perl版本的rename? perl -MCPAN -e 'install File::Rename' 阅读全文
posted @ 2021-05-06 19:07 一只小小郑 阅读(611) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: ;; init.el (custom-set-variables ;; uncomment to always end a file with a newline ;'(require-final-newline t) ;; uncomment to disable loading of "defa 阅读全文
posted @ 2021-03-29 19:29 一只小小郑 阅读(35) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 之前安装Biopython和Numpy的时候遇到了一些问题,这里找到了一个解决的方案。 报错结果 Traceback (most recent call last): File "/usr/share/pypy/pypy3.8/site-packages/numpy/core/__init__.py 阅读全文
posted @ 2021-03-13 20:43 一只小小郑 阅读(1098) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 原文: https://segmentfault.com/a/1190000012055972 如何在 blast 输出结果中添加物种名称 - SegmentFault 思否 最近做一个项目需要利用 blastn 结果来画出进化树,这样就需要有物种名称。 最近做一个项目需要利用blastn结果来画出 阅读全文
posted @ 2021-03-12 21:38 一只小小郑 阅读(1617) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: The Use of Anaconda and Biodonda When bio-informatician want to search and install some software, he/she may scratches the head. Luckily, the automati 阅读全文
posted @ 2021-02-20 21:11 一只小小郑 阅读(50) 评论(0) 推荐(0) 编辑