摘要：
Assemblytics， 发表在Bioinformaticshttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27318204，鉴定基因组间SV。 Githup，https://github.com/marianattestad/assemblytics 同时也可以在线使用，h 阅读全文
摘要：
本文学习费章军老师文章Genome of Solanum pimpinellifolium provides insights into structural variants during tomato breeding 如何鉴定SV。 其流程见 https://github.com/GaoLei 阅读全文
摘要：
与核基因组相比，细胞器基因组相对来说，更为保守，并且序列较短，更加易于组装，仅仅根据二代测序reads即可进行组装。 下面简单介绍我在本项目中的方法，仅供参考。 1 数据 本次我使用的二代数据为50X。下机后，首先通过fastq对其进行过滤，改软件操作较为简单，仅仅使用-q 20进行过滤，得到cle 阅读全文
摘要：
REPuter可注释叶绿体重复序列，包括4种类型，Forward（F）, Reverse (R), Complement (C), Palindromic (P)。 REPuter 是可在线注释， 详情可戳参考文献、 Robert* REPuter: The Manifold Application 阅读全文