摘要: 若已经拿到表达矩阵exprSet 若差异较大,进行log缩小不同样本的差距 1、热图全体 1 ##加载包 2 library(pheatmap) 3 4 ##缩小表达量差距 5 exprSet <- log2(exprSet+1) 6 7 ##取最大标准差前1000个基因名字 8 cg <-name 阅读全文
posted @ 2020-02-05 22:07 斩毛毛 阅读(7071) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 根据拿到的表达矩阵设为exprSet 1、用scale 进行标准化 数据中心化:数据集中的各个数字减去数据集的均值 数据标准化:中心化之后的数据在除以数据集的标准差。 在R中利用scale方法来对数据进行中心化和标准化 1 scale(data, center=T, scale=F) 2 3 其中, 阅读全文
posted @ 2020-02-05 20:58 斩毛毛 阅读(4325) 评论(0) 推荐(1) 编辑