摘要：
miRNA分析--数据过滤（一） miRNA分析--比对（二） 根据miRNA Target Prediction in Plants, miRNA并非所有区域都要求严格匹配，其中第1位碱基和第14位以后的碱基是允许错配(以miRNA 5'为始)。 miRNA 文件提交不管是U或者T都是可以的 mi 阅读全文
摘要：
miRNA分析--数据过滤（一） 在比对之前为了减少比对时间，将每一个样本中的reads进行合并，得到fasta格式，其命名规则如下： 样本_r数子_x数字 r 中的数字表示reads序号； x 中的数字表示该条reads重复次数 比对分为两条策略 1、根据本物种已有的miRNA序列进行比对， 已知 阅读全文
摘要：
miRNA 数据过滤我使用cutadapt 1 cutadapt -a AGATCGGAAGAGCACACGTCT -m 15 -q 20 --discard-untrimmed -o outname .fa --discard-untrimmed 把reads中不含有adaper的reads去掉 阅读全文