在比较基因组学的时候，经常会听到“共线性”这个词，但是与其对应的有两个不同的概念，即
(1) synteny
(2) collinear
二者的区别如下图所示：
可以看到，syntenic，表示的共线性区域，其基因顺利可以不同；
但是， collinear，表示的共线性区域，其基因顺序一致。
