生信转岗心得

    应健明的邀请，我也写一篇关于转行做生物信息的心得，本来以为很轻松就可以写出来的，但是发现并不那么好写。如果放在去年刚转岗之时，我想应该更顺手，那时感触良多且深刻。不过我虽是个健忘的人，但是还清醒地记得去年7月份通过公司的转岗答辩之时，心情无比的愉快与美丽，觉得终于从一名生信爱好者成为一名正规军。之前为了转岗，经常在业余时间学习编程和生信的知识，有时甚至在不是很忙的工作时间也学，但是由于背着生化工程师的身份，所以总感觉自己是地下党。答辩通过后，在公司终于可以名正言顺地做生信的工作了，地下党的身份合法化了，瞬间感觉神清气爽了。很开心的另外一个原因就是自己以后可以有更多的时间做生信、学生信了，比以前只是业余来学习应该会进步更快。

   做生物信息的人，我相信很多都是半路出家的，但是猜测很多都是在读研的时候因课题需要才转做生信的，但是像我这样在公司里跳过去的应该不多（我没有统计，只是感觉），或者至少比在学校里转起来更困难些，因为在公司不比学校，公司需要工作效益，所以很难接受一个没有任何生信经验的人在这个岗位上，何况我在这个公司的生化研发岗位做了近两年的时间。不过感恩的是，我们公司真的很nice，当我提出转岗需求的时候，我的顶头上司——当时的化学部总监——TA非常支持我，认为我应该追求自己想做的东西，只要我思考清楚，Ta就会支持我。我当时非常感动，要知道这是从TA的手下撤走呀。不过我提出转岗也是寻找合适的机会才说的。记得当时2016年12月底，我们公司有一个秘密项目刚刚结束，而我就在这个项目中负责一块任务，所以一旦这个项目结束，意味着我们这些项目的人面临调整，同时调整期我有会闲一些，所以本着卡空档，不添乱的的想法，赶紧和我的总监正式提转岗的需求，所以总监也非常热心的答应帮助我。此外早前我也和上司通过气，也就是2016年9月份，有一次和上司在路上，TA问我后面有什么规划没有？我当时就透露了想转做生信的想法，但是没有表现出很急切，因为这个时候公司的秘密项目正式启动，正是需要人手的时候，而且大家每天都很忙，所以我也仅仅是透了个风，这就是为什么当我12月底正式提出转岗时，上司第一反应不是诧异，而是赞同和支持，觉得我之前说说而已的想法居然要付出行动了。 正式提出转岗后，总监立马帮我和老板申请，老板也表示很理解与支持，所以后来我就进入差不多6个月的考察期，这期间每天正式工作还是生化的内容，但是逐渐减少生化内容并尝试给我一些生信相关的工作，相当于是一个过渡期吧，我抓住这个过渡期，每天大量学习、提升编程能力，也跟着健明的《生信编程直播题》学了不少入门知识。最后写了一个大约6-700行的NIPT分析程序，快速地提高了我python的编程能力，并最终以这个项目为转岗答辩的题目。

   除了当时的上司和老板让我感激之外，让我最感谢的是公司的生信组的组长——我现在的上司。他这个人太nice了，性格随和又乐于助人。当我2016年7月和他提出想做生信的时候，他毫不犹豫的表示欢迎。虽然当时只是在上班路上碰到后走在一起随意地聊，但是我随后又非常认真的询问 申请转生信岗是否可行时，他开始认真地帮助我，并给我一些小项目，让我练手并熟悉生信工作内容，同时时常告诉我生信小组的人手情况，对新增人手的需求的紧迫性等等，让我抓住恰当时机申请转岗。这样我对生信小组的情况比较了解，也知道生信小组确实需要人手，最后提出申请就非常顺应公司状况。此外在我的过渡期，有一次公司组织旅游，我和组长住在一个房间里，我给他看我写的代码，他真一行一行的给我看，然后分析如何让我顺利的被公司承认我生信工程师的身份（当时公司虽然同意我转做生信，但是编制以及工作内容都还是生化，而且公司没有这个先例，所以没有人知道该如何处理我这个转岗案件），最后我们经过讨论认为可以将NIPT作为练手的项目，并将它的结果作为一次报告，做一次转岗答辩，以正式证明我的编程能力、项目完成能力等。最后我确实是通过这种模式，才正式成为一枚生信猿。后来这种模式也被公司定为内部转岗的标准模式。现在我每天的工作伙伴就是这位思维敏捷，性格开朗随和的生信组组长，我每天的工作非常愉快，加上又做着自己喜欢的工作内容。

     说了这么多转行做生信经过，其实我最想说的是转做生信的动机。我是湿实验出身，正如上文提到每天和生化试剂打交道。我转做生信时很多当时的化学同事们问我“是讨厌做实验才转行的？“ 我说“并不是”。我之所以决定转做生信，是结合自身的性格、爱好，决定了真的要从事生物研究的工作，并判断利用计算机、信息理论来处理生物问题一定是未来的方向。所以我的聚焦点依然是生物，只不过是手段有点改变而已。也正是这样的定位，所以绝不会将生信作为进入IT、其它行业的数据分析等等的跳板。而且必要的时候，湿实验也是可以重拾的，一切要看以后的接触的课题需要。而且几乎所有的干实验的数据都来源于湿实验，所以干湿实验对解决生物问题都是非常重要的。最近通过干湿结合的方法来解决生物问题越来越流行，这种文章也越来越多，尤其是那些比较宏大的课题更是如此。

    生信这个行当，要求可高可低，低的只是应用几个软件跑几个流程都可以自称生信工程师（感觉在说自己），高的........我还不是这个层次的，不瞎掰掰了，反正这深度够我探索一辈子的，不用担心什么碰到技术天花板了。方向也真是千差万别，有做基础工程的，给生信分析软件库添砖加瓦；也有应用这些软件的，来解决各种实际生物问题。所以有些人重编程，弱生物知识；有些人重生物知识，弱编程。我生物湿实验背景出身，预计将是第二类生信猿。但是无论哪种猿，要想在自己方向做深，唯有统计学与算法思想是不可或缺的。统计学与算法思想将决定在生信路走多深。我也深知自己统计学知识薄弱，定当加强这方面的知识。

   以上是我转岗做生信的真实经历与动机，并夹杂了少许对生信得理解。夜已深，要睡了，作为生信猿小菜鸟，明天继续搬砖码码。。。。。。