使用AWS SageMaker进行机器学习项目

使用AWS SageMaker进行机器学习项目

本文主要介绍如何使用AWS SageMaker进行机器学习项目。

1. 题目

使用的题目为阿里天池的“工业蒸汽量预测“,题目地址为:

https://tianchi.aliyun.com/competition/entrance/231693/introduction

 

给定的数据: 脱敏后的锅炉传感器采集的数据(采集频率为分钟级)

预测目标: 根据锅炉的工况,预测产生的蒸汽量。

数据说明: 数据分成训练数据(train.txt)和测试数据(test.txt),其中字段”V0”-“V37”,这38个字段是作为特征变量,”target”作为目标变量。选手利用训练数据训练出模型,预测测试数据的目标变量,排名结果依据预测结果的MSE(mean square error)。

结果评估: 预测结果以mean square error作为评判标准。

 

2. AWS SageMaker

AWS SageMaker是亚马逊云科技提供的机器学习服务,它整合了专门为ML可用的功能集,帮助数据科学家和开发人员快速准备、构建、训练和部署高质量的机器学习模型。

我们首先使用的是 AWS SageMaker的Notebook Instance进行数据的探索、清洗以及准备。在Notebook Instance中运行了一个Jupyter notebook server,可以在其上编写代码并做相关测试。例如:

 在Jupyter中创建一个conda_python3 的notebook,即可开始对数据进行探索与处理。

 

3. 数据探索

3.1. 初步探索

先简单查看一下数据:

import pandas as pd
import s3fs
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import seaborn as sns
from scipy import stats

plt.style.use('seaborn')
%matplotlib inline

train_raw = pd.read_csv(train_data_uri, sep='\t', encoding='utf-8')
test_raw = pd.read_csv(test_data_uri, sep='\t', encoding='utf-8')

train_raw.head()

 

train_raw.info()
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
RangeIndex: 2888 entries, 0 to 2887
Data columns (total 39 columns):
 #   Column  Non-Null Count  Dtype  
---  ------  --------------  -----  
 0   V0      2888 non-null   float64
 1   V1      2888 non-null   float64
 2   V2      2888 non-null   float64
 …
 37  V37     2888 non-null   float64
 38  target  2888 non-null   float64
dtypes: float64(39)
memory usage: 880.1 KB

从训练集 info 信息我们可以知道,在训练集中:

  1. 一共有2888 个样本, 38个字段(V0 - V37) ,1个 target
  2. 所有特征均为连续型特征
  3. Label为连续型,所以我们需要回归函数进行预测
  4. 所有特征均没有空置

测试集 info():

test_raw.info()
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
RangeIndex: 1925 entries, 0 to 1924
Data columns (total 38 columns):
 #   Column  Non-Null Count  Dtype  
---  ------  --------------  -----  
 0   V0      1925 non-null   float64
 1   V1      1925 non-null   float64
 2   V2      1925 non-null   float64
 …
 36  V36     1925 non-null   float64
 37  V37     1925 non-null   float64
dtypes: float64(38)
memory usage: 571.6 KB

从测试集info() 我们可以了解到,在测试集中:

  1. 一共有1925个样本,38个字段(V0 - V37)
  2. 所有特征均为连续型
  3. 没有缺失值

若是进一步对df 做 describe(),则会有 39 个字段的describe数据,从观察数据的角度来看,比较复杂,所以下一步我们对数据进行可视化。

 

3.2. 数据可视化

3.2.1. 盒图

首先我们通过boxplot 探索离群点,首先以特征V1为例:

fig = plt.figure(figsize=(4, 6))
sns.boxplot(train_raw[['V1']], orient='v', width=0.5, palette="Set3")

可以看到此特征有非常多的离群点。然后我们将所有特征进行盒图可视化:

# boxplot for all features
columns = train_raw.columns[:-1]

fig = plt.figure(figsize=(80, 100), dpi=75)
for i in range(len(columns)):
    plt.subplot(7, 6, i+1)
    sns.boxplot(train_raw[columns[i]], orient='v', width=0.5, palette="Set3")
    plt.ylabel(columns[i])
plt.show()

部分结果如下:

从这个结果来看,大部分特征或多或少均存在离群点,后续在特征工程阶段需要对此进行进一步处理。

 

3.2.2. 直方图与Q-Q图

接下来探索数据的分布情况,是否为正态分布。通过直方图与Q-Q图进行探索。

先以V0 特征为例:

plt.figure(figsize=(10, 5))

ax1 = plt.subplot(121)
sns.distplot(train_raw['V0'], fit=stats.norm)

ax2 = plt.subplot(122)
res = stats.probplot(train_raw['V0'], plot=plt)

可以看到训练集中V0 特征并非为正态分布。接下来我们绘制所有特征的直方图与Q-Q图:

import warnings

warnings.filterwarnings("ignore")

plt.figure(figsize=(80, 190))

ax_index = 1

for i in range(len(columns)):
    ax = plt.subplot(19, 4, ax_index)
    sns.distplot(train_raw[columns[i]], fit=stats.norm)
    ax_index += 1
    
    ax = plt.subplot(19, 4, ax_index)
    res = stats.probplot(train_raw[columns[i]], plot=plt)
    ax_index += 1
    

部分结果如下:

可以看到其中有的特征符合正态分布,但大部分并不符合,数据并不跟随对角线分布。对此,后续可以使用数据变换对其进行处理。

 

3.2.3. KDE分布图

KDE(Kernel Density Estimation,核密度估计)可以理解为是对直方图的加窗平滑。我们可以通过此图比较直观的看出数据本身的分布特征。

这里我们通过绘制KDE图,查看并对比训练集和测试集中特征变量的分布情况,来发现两个数据集中分布不一致的特征变量。

先仍以特征V0为例:

plt.figure(figsize=(10, 8))
ax = sns.kdeplot(train_raw['V0'], color="Red", shade=True)
ax = sns.kdeplot(test_raw['V0'], color="Blue", shade=True)
ax.set_xlabel("V0")
ax.set_ylabel("Frequency")
ax.legend(['train', 'test'])

可以看到 V0 在两个数据集中的分布基本一致。然后对所有特征画出训练集与测试集中的KDE分布:

# all features' kde plots

plt.figure(figsize=(40, 100))
ax_index = 1

for i in range(len(columns)):
    ax = plt.subplot(10, 4, ax_index)
    ax = sns.kdeplot(train_raw[columns[i]], color="Red", shade=True)
    ax = sns.kdeplot(test_raw[columns[i]], color="Blue", shade=True)
    ax.set_xlabel(columns[i])
    ax.set_ylabel("Frequency")
    ax.legend(['train', 'test'])
    ax_index += 1

可以看到大部分特征的分布在训练集与测试集中基本一致,但仍有几个特征的分布在两个数据集中不一致(主要为V5、V9、V11、V17、V22、V28),这样会导致模型的泛化能力变差,可以考虑删除这些特征。

 

3.2.4. 线性回归关系图

线性回归关系图主要用于分析特征与label之间的线性相关性。

先看特征V0 与label的线性相关性:

plt.figure(figsize=(10, 8))

ax = plt.subplot(121)
sns.regplot(x='V0', y='target', data=train_raw, ax=ax, scatter_kws={'marker':'.', 's':4, 'alpha':0.3},
            line_kws={'color':'g'})
plt.xlabel('V0')
plt.ylabel('target')

plt.show()

从plot结果来看,可以看到V0特征与label是存在一定的相关性。接下来 plot所有特征与label的相关性:

plt.figure(figsize=(16, 32))

for i in range(len(columns)):
    ax = plt.subplot(10, 4, i+1)
    sns.regplot(x=columns[i], y='target', data=train_raw, ax=ax, scatter_kws={'marker':'.', 's':4, 'alpha':0.3},
            line_kws={'color':'g'})
    ax.set_xlabel(columns[i])
ax.set_ylabel('target')

 

部分结果如下所示:

 

从结果来看,有不少特征与label有较强相关性(例如V0,V1,V8,V27,V31,…等),但是仍有部分特征与label之间基本无相关性(例如V9,V10,V13,V14,…等)。

当然这里只检查的是线性相关,并非表示特征与label之间没有其他相关性(例如非线性相关性)。

 

3.2.5. 线性相关性与热力图

变量之间的相关性通过协方差矩阵进行衡量,首先计算协方差矩阵并按与target相关性高低进行排序:

train_corr = train_raw.corr()
abs(train_corr['target']).sort_values(ascending=False, inplace=False)

target    1.000000
V0        0.873212
V1        0.871846
V8        0.831904
...
V21       0.010063
V14       0.008424
V34       0.006034
Name: target, dtype: float64

 

可以看到与label的相关性低于0.1 的特征有:V33,V32,V26,V25,V21,V14,V34。

通过热力图可视化:

筛选出与label相关性大于0.1的特征:

corr_columns = train_corr[abs(train_corr['target']) > 0.1]['target'].index.tolist()[:-1]

['V0',
 'V1',
 'V2',
...'V37']

 

4. 特征工程

根据数据探索过程中观察到的现象,现在对数据做第一次特征处理。

 

4.1. 离群点

之前在boxplot中可以看到大部分特征存在离群点,一般会对离群点的处理是进行删除。不过在这个数据集中,删除过多的数据条目是不可接受的,所以我们会手动定义一个更大的范围,用于过滤离群点。

首先绘出所有特征的boxplot:

plt.figure(figsize=(36, 20))
green_diamond = dict(markerfacecolor='g', marker='o')

plt.boxplot(train_raw.T, labels=train_raw.columns, showbox=True, showfliers=True, patch_artist=True,
            flierprops=green_diamond)

plt.show()

从图中能看到偏离较大的是V9的特征,这里从保守的角度,保留[-7.5, +7.5] 之间的数据。

train_drop_outlier = train_raw[train_raw['V9'] > -7.5]
test_drop_outlier = test_raw[test_raw['V9'] > -7.5]

 

4.2. 剔除特征

通过KDE分布图,可以找到几个特征在训练集与测试集中的分布不一致,会导致模型的泛化能力变差,所以删除V5、V9、V11、V17、V22、V28这几个特征。

train_dropped_feature = train_drop_outlier.drop(['V5', 'V9', 'V11', 'V17', 'V22', 'V28'], axis=1)
test_dropped_feature = test_drop_outlier.drop(['V5', 'V9', 'V11', 'V17', 'V22', 'V28'], axis=1)

 

4.3. 归一化

由于各个特征的取值范围并不一致,需要对所有数值类型做归一化:

# min_max_scaler
from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler

# target feature does not need to be scaled
train_dropped_target = train_dropped_feature.drop(['target'], axis=1)
feature_columns = train_dropped_target.columns.tolist()

# min_max_scale fit on trainging data
min_max_scaler = MinMaxScaler().fit(train_dropped_target)

# min_max scale transform on both training and test data
train_scaled = min_max_scaler.transform(train_dropped_target)
test_scaled = min_max_scaler.transform(test_dropped_feature)

train_scaled = pd.DataFrame(train_scaled, columns=feature_columns)
train_scaled['target'] = train_dropped_feature['target']

test_scaled = pd.DataFrame(test_scaled, columns=feature_columns)

 

4.4. PCA降维

PCA降维除了用于减少数据维度外,还能够去除数据的多重性。下面使用PCA处理,保留95%的信息:

# PCA
from sklearn.decomposition import PCA

pca = PCA(n_components=0.99)

train_pca_99 = pca.fit_transform(train_scaled.iloc[:,0:-1])
test_pca_99 = pca.transform(test_scaled)

train_pca_99 = pd.DataFrame(train_pca_99)
train_pca_99['target'] = train_dropped_feature['target']

test_pca_99 = pd.DataFrame(test_pca_99)

 

5. 模型训练

在数据进行了预处理后,下面即可开始使用模型进行训练。首先切分train_pca_99为训练集、验证集和测试集:

# train test split
from sklearn.model_selection import train_test_split

train_pca_99 = train_pca_99.dropna()

train_data_fin = train_pca_99.drop(['target'], axis=1)
train_data_fin_target = train_pca_99['target']

train_data, test_data, train_target, test_target = train_test_split(train_data_fin, train_data_fin_target, test_size=0.2)

print(train_data.shape, test_data.shape, train_target.shape, test_target.shape)

(2307, 25) (577, 25) (2307,) (577,)

 

6. 集成模型

在完成一个机器学习项目时,一般不会仅使用单个模型完成预测,而是使用多个模型的结果进行集成。当前几个主流的集成方法包括:Bagging,Boosting以及Stacking。在这个例子中,我们会使用Bagging,通过SageMaker分别训练一个XGBoost 和一个LinearLeaner,然后在预测时,使用它们的平均值作为预测输出。

 

6.1. XGBoost

在SageMaker中,对于XGBoost模型训练的输入规则是:

  1. 对于训练 ContentType,有效输入是 text/libsvm(默认值)或 text/csv
  2. 对于 CSV 训练,算法假定目标变量在第一列中,而 CSV 没有标头记录。

所以我们需要先将label列作为训练数据的第一列,并写为一个csv文件,再上传到s3,代码如下:

# put label at the first col
train_data.insert(0, 'target', train_target)

# split train_data into data_train and data_val
train_list = np.random.rand(len(train_data)) < 0.8
data_train = train_data[train_list]
data_val = train_data[~train_list]

# save them locally
data_train.to_csv("formatted_train.csv", sep=',', header=False, index=False) # save training data
data_val.to_csv("formatted_val.csv", sep=',', header=False, index=False) # save validation data
test_data.to_csv("formatted_test.csv", sep=',', header=False,  index=False) # save test data

# upload to s3
import os

bucket = 'tang-sagemaker'
prefix = 'ZhengQi_data'

train_file = 'formatted_train.csv'
val_file = 'formatted_val.csv'

boto3.Session().resource('s3').Bucket(bucket).Object(os.path.join(prefix, 'train/', train_file)).upload_file(train_file)
boto3.Session().resource('s3').Bucket(bucket).Object(os.path.join(prefix, 'val/', val_file)).upload_file(val_file)

 

指定训练参数并进行训练:

# another approach

# training
from sagemaker import get_execution_role
import sagemaker

role = get_execution_role()
sess = sagemaker.Session()

s3_output_location = f's3://{bucket}/{prefix}/output/'

train_channel = sagemaker.inputs.TrainingInput(f's3://{bucket}/{prefix}/train/formatted_train.csv', content_type='text/csv')
val_channel = sagemaker.inputs.TrainingInput(f's3://{bucket}/{prefix}/val/formatted_val.csv', content_type='text/csv')

container = sagemaker.image_uris.retrieve('xgboost', 'cn-north-1', 'latest')

xgb_model = sagemaker.estimator.Estimator(container,
                                         role, 
                                         instance_count=1, 
                                         instance_type='ml.m4.xlarge',
                                         volume_size = 5,
                                         output_path=s3_output_location,
                                         sagemaker_session=sagemaker.Session(),
                                         enable_sagemaker_metrics=False)

xgb_model.set_hyperparameters(
    max_depth = 5,
    gamma = 1,
    min_child_weight = 1,
    objective = 'reg:squarederror',
    eval_metric = 'rmse',
    num_round = 100,
    early_stopping_rounds=10
)

xgb_model.fit({'train': train_channel, 'validation':val_channel})

以此参数进行训练后的结果为:

[24]#011train-rmse:0.311867#011validation-rmse:0.530562

Stopping. Best iteration:

[14]#011train-rmse:0.32222#011validation-rmse:0.528132

 

可以看到最低的rmse结果为0.5281。

 

6.1.1. XGBoost超参数调优

在进行超参数调优时,可以启动一个超参数优化任务。原理与sklearn中的超参数搜索(例如GridSearch,RandomeizedSearch等)类似。这里我们选择随机超参数搜索,代码如下:

from sagemaker.tuner import ContinuousParameter, HyperparameterTuner

objective_metric_name = 'validation:rmse'
hyperparameter_ranges = {
    'alpha': ContinuousParameter(0.01, 10, scaling_type="Logarithmic"),
    'lambda': ContinuousParameter(0.01, 10, scaling_type="Logarithmic")
}

tuner_log = HyperparameterTuner(
    xgb_model,
    objective_metric_name,
    hyperparameter_ranges,
    objective_type='Minimize',
    max_jobs=20,
    max_parallel_jobs=10,
    strategy='Random'
)

tuner_log.fit({'train': train_channel, 'validation': val_channel}, include_cls_metadata=False)

 

探索结果:

df_log = sagemaker.HyperparameterTuningJobAnalytics(tuner_log.latest_tuning_job.job_name).dataframe()
df_log['FinalObjectiveValue'].sort_values(ascending=True, inplace=False)[:3]

11    0.523109
18    0.524432
10    0.525883
Name: FinalObjectiveValue, dtype: float64

df_log.loc[11]
alpha                                                0.0187497
lambda                                                 5.70063
TrainingJobName               xgboost-210409-1554-009-70f060d0
TrainingJobStatus                                    Completed
FinalObjectiveValue                                   0.523109
TrainingStartTime                    2021-04-09 15:58:27+00:00
TrainingEndTime                      2021-04-09 15:59:34+00:00
TrainingElapsedTimeSeconds                                  67
scaling                                                    log
Name: 11, dtype: object

可以看到在这次超参数搜索中,排名最好的alpha和lambda参数组为:

alpha                                                0.0187497

lambda                                                 5.70063

 

对应的训练job为:xgboost-210409-1554-009-70f060d0

 

6.1.2. XGBoost模型部署

创建此训练job对应的模型:

# create model
sm = boto3.client('sagemaker')

best_xgboost_model = df_log.loc[df_log['FinalObjectiveValue'].idxmin()]['TrainingJobName']
model_name=best_xgboost_model + '-mdl'

xgboost_hosting_container = {
    'Image': container,
    'ModelDataUrl': sm.describe_training_job(TrainingJobName=best_xgboost_model)['ModelArtifacts']['S3ModelArtifacts']
}

create_model_response = sm.create_model(
    ModelName=model_name,
    ExecutionRoleArn=role,
PrimaryContainer=xgboost_hosting_container)

 

指定部署模型的配置:

from time import gmtime, strftime

endpoint_config_name = 'XGBoostEndpointConfig-' + strftime("%Y-%m-%d-%H-%M-%S", gmtime())
print(endpoint_config_name)

create_endpoint_config_response = sm.create_endpoint_config(
    EndpointConfigName = endpoint_config_name,
    ProductionVariants=[{
        'InstanceType':'ml.m4.xlarge',
        'InitialInstanceCount':1,
        'InitialVariantWeight':1,
        'ModelName':model_name,
        'VariantName':'AllTraffic'}])

print("Endpoint Config Arn: " + create_endpoint_config_response['EndpointConfigArn'])

 

部署模型到终端节点:

# create endpoint
import time

endpoint_name = 'XGBoostEndpoint-' + strftime("%Y-%m-%d-%H-%M-%S", gmtime())
print(endpoint_name)
create_endpoint_response = sm.create_endpoint(
    EndpointName=endpoint_name,
    EndpointConfigName=endpoint_config_name)
print(create_endpoint_response['EndpointArn'])

resp = sm.describe_endpoint(EndpointName=endpoint_name)
status = resp['EndpointStatus']
print("Status: " + status)

while status=='Creating':
    time.sleep(60)
    resp = sm.describe_endpoint(EndpointName=endpoint_name)
    status = resp['EndpointStatus']
    print("Status: " + status)

print("Arn: " + resp['EndpointArn'])
print("Status: " + status)

 

6.1.3. XGBoost模型验证

文件为csv格式,需要转为numpy 数组,然后发送到部署好的终端节点,并获取到模型的预测值:

import io
import sys

runtime= boto3.client('runtime.sagemaker')

# Simple function to create a csv from our numpy array
def np2csv(arr):
    csv = io.BytesIO()
    np.savetxt(csv, arr, delimiter=',', fmt='%g')
    return csv.getvalue().decode().rstrip()

# Function to generate prediction through sample data
def do_predict(data, endpoint_name, content_type):
    payload = np2csv(data)
    response = runtime.invoke_endpoint(EndpointName=endpoint_name,
                                   ContentType=content_type,
                                   Body=payload)
    result = response['Body'].read()
    result = result.decode("utf-8")
    result = result.split(',')
    preds = [float((num)) for num in result]
    return preds

# Function to iterate through a larger data set and generate batch predictions
def batch_predict(data, batch_size, endpoint_name, content_type):
    items = len(data)
    arrs = []

    for offset in range(0, items, batch_size):
        if offset+batch_size < items:
            datav = data.iloc[offset:(offset+batch_size),:].values
            results = do_predict(datav, endpoint_name, content_type)
            arrs.extend(results)
        else:
            datav = data.iloc[offset:items,:].values
            arrs.extend(do_predict(datav, endpoint_name, content_type))
        sys.stdout.write('.')
    return(arrs)

 

获得训练数据、预测数据以及测试数据的预测值后,使用均方误差进行评估:

# do prediction
preds_train_xgb = batch_predict(data_train.iloc[:, 1:], 1000, endpoint_name, 'text/csv')
preds_val_xgb = batch_predict(data_val.iloc[:, 1:], 1000, endpoint_name, 'text/csv')
preds_test_xgb = batch_predict(data_test, 1000, endpoint_name, 'text/csv')

# evaluation
from sklearn.metrics import mean_squared_error

train_labels = data_train.iloc[:,0];
val_labels = data_val.iloc[:,0];

print("Training MSE", mean_squared_error(train_labels, preds_train_xgb)) 
print("Validation MSE", mean_squared_error(val_labels, preds_val_xgb))
print("Test MSE", mean_squared_error(test_target, preds_test_xgb))

Training MSE 0.10267861046608459
Validation MSE 0.27399804734388417
Test MSE 0.3310241908011309

从这个结果可以看出,模型稍微存在过拟合,在测试集上的误差要比测试集上的误差高0.23左右。

下面我们再训练第二个模型。

 

6.2. LinearLearner

在SageMaker中,LinearLearner模型训练的输入规则是:

  1. 输入格式支持recordIO-wrapped protobuf 和 CSV 格式
  2. 对于 text/csv 输入类型,第一列假定为标签,即预测的目标变量

前面我们已经处理好格式,下面直接指定参数并进行训练:

# train a linear model
s3_output_location_linear = f's3://{bucket}/{prefix}/linear_output/'

container = sagemaker.image_uris.retrieve("linear-learner", boto3.Session().region_name, version="1")


linear_model = sagemaker.estimator.Estimator(
    container,
    role,
    input_mode="File",
    instance_count=1,
    instance_type="ml.m4.xlarge",
    output_path=s3_output_location_linear,
    sagemaker_session=sess,
)

linear_model.set_hyperparameters(
    feature_dim=8,
    epochs=16,
    wd=0.01,
    loss="absolute_loss",
    predictor_type="regressor",
    normalize_data=False,
    optimizer="adam",
    mini_batch_size=100,
    lr_scheduler_step=100,
    lr_scheduler_factor=0.99,
    lr_scheduler_minimum_lr=0.0001,
    learning_rate=0.1,
)

linear_model.fit({'train': train_channel, 'validation':val_channel})

 

训练结束后打印的指标为:

#validation_score (algo-1) : ('mse_objective', 0.31672970836480807)

#validation_score (algo-1) : ('mse', 0.31672970836480807)

 

可以看到在验证集上的均方误差为0.3167

 

6.2.1. LinearLearner 超参数调优

同样使用HyperparameterTuner 进行调优:

objective_metric_name = 'validation:objective_loss'
hyperparameter_ranges = {
    'learning_rate': ContinuousParameter(0.01, 0.1, scaling_type="Logarithmic"),
    'l1': ContinuousParameter(0.01, 0.1, scaling_type="Logarithmic"),
    'wd': ContinuousParameter(0.01, 0.1, scaling_type="Logarithmic")
}

tuner_linear_log = HyperparameterTuner(
    linear_model,
    objective_metric_name,
    hyperparameter_ranges,
    objective_type='Minimize',
    max_jobs=30,
    max_parallel_jobs=10,
    strategy='Random'
)

tuner_linear_log.fit({'train': train_channel, 'validation': val_channel}) 

 

探索结果:

tuner_linear_log = sagemaker.HyperparameterTuningJobAnalytics(tuner_linear_log.latest_tuning_job.job_name).dataframe()
tuner_linear_log['FinalObjectiveValue'].sort_values(ascending=True, inplace=False)[:3]

23    0.315122
17    0.316627
2     0.318820
Name: FinalObjectiveValue, dtype: float64

tuner_linear_log.loc[23]

l1                                                           0.013238
learning_rate                                               0.0322787
wd                                                           0.010156
TrainingJobName               linear-learner-210409-1752-007-7c0938e8
TrainingJobStatus                                           Completed
FinalObjectiveValue                                          0.315122
TrainingStartTime                           2021-04-09 17:55:43+00:00
TrainingEndTime                             2021-04-09 17:57:01+00:00
TrainingElapsedTimeSeconds                                         78
Name: 23, dtype: object

可以看到在这次超参数搜索中,排名最好的l1,learning_rate,wd参数组为:

l1                                                           0.013238

learning_rate                                               0.0322787

wd                                                           0.010156

 

对应的训练job为:linear-learner-210409-1752-007-7c0938e8

 

6.2.2 LinearLearner 模型部署

创建此训练job对应的模型:

# create model
best_linear_model = tuner_linear_log.loc[tuner_linear_log['FinalObjectiveValue'].idxmin()]['TrainingJobName']
model_name=best_linear_model + '-lmdl'

linear_hosting_container = {
    'Image': container,
    'ModelDataUrl': sm.describe_training_job(TrainingJobName=best_linear_model)['ModelArtifacts']['S3ModelArtifacts']
}

create_model_response = sm.create_model(
    ModelName=model_name,
    ExecutionRoleArn=role,
PrimaryContainer=linear_hosting_container)

 

指定部署模型的配置:

from time import gmtime, strftime

endpoint_config_name = 'LinearEndpointConfig-' + strftime("%Y-%m-%d-%H-%M-%S", gmtime())
print(endpoint_config_name)

create_endpoint_config_response = sm.create_endpoint_config(
    EndpointConfigName = endpoint_config_name,
    ProductionVariants=[{
        'InstanceType':'ml.m4.xlarge',
        'InitialInstanceCount':1,
        'InitialVariantWeight':1,
        'ModelName':model_name,
        'VariantName':'AllTraffic'}])

print("Endpoint Config Arn: " + create_endpoint_config_response['EndpointConfigArn'])

 

部署模型到终端节点:

# create endpoint
import time

endpoint_name = 'LinearEndpoint-' + strftime("%Y-%m-%d-%H-%M-%S", gmtime())
print(endpoint_name)
create_endpoint_response = sm.create_endpoint(
    EndpointName=endpoint_name,
    EndpointConfigName=endpoint_config_name)
print(create_endpoint_response['EndpointArn'])

resp = sm.describe_endpoint(EndpointName=endpoint_name)
status = resp['EndpointStatus']
print("Status: " + status)

while status=='Creating':
    time.sleep(60)
    resp = sm.describe_endpoint(EndpointName=endpoint_name)
    status = resp['EndpointStatus']
    print("Status: " + status)

print("Arn: " + resp['EndpointArn'])
print("Status: " + status)

 

6.2.3. LinearLearnerr模型验证

import json

def np2csv(arr):
    csv = io.BytesIO()
    np.savetxt(csv, arr, delimiter=',', fmt='%g')
    return csv.getvalue().decode().rstrip()

# Function to generate prediction through sample data
def do_predict_linear(data, endpoint_name, content_type):

    payload = np2csv(data)
    response = runtime.invoke_endpoint(EndpointName=endpoint_name,
                                   ContentType=content_type,
                                   Body=payload)
    result = json.loads(response['Body'].read().decode())
    preds =  [r['score'] for r in result['predictions']]

    return preds

# Function to iterate through a larger data set and generate batch predictions
def batch_predict_linear(data, batch_size, endpoint_name, content_type):
    items = len(data)
    arrs = []

    for offset in range(0, items, batch_size):
        if offset+batch_size < items:
            datav = data.iloc[offset:(offset+batch_size),:].values
            results = do_predict_linear(datav, endpoint_name, content_type)
            arrs.extend(results)
        else:
            datav = data.iloc[offset:items,:].values
            arrs.extend(do_predict_linear(datav, endpoint_name, content_type))
        sys.stdout.write('.')
    return(arrs)

### Predict 
preds_train_lin = batch_predict_linear(data_train.iloc[:,1:], 100, endpoint_name , 'text/csv')
preds_val_lin = batch_predict_linear(data_val.iloc[:,1:], 100, endpoint_name , 'text/csv')
preds_test_lin = batch_predict_linear(data_test, 100, endpoint_name , 'text/csv')

print("Training MSE", mean_squared_error(train_labels, preds_train_lin)) 
print("Validation MSE", mean_squared_error(val_labels, preds_val_lin))
print("Test MSE", mean_squared_error(test_target, preds_test_lin))

Training MSE 0.3205520723200668
Validation MSE 0.3153403808426263
Test MSE 0.37555825359647615

可以看到LinearLearner的泛化性能较好,验证集和测试集上的表现没有出现太大偏差,但是准确度并不优秀。

 

6.3. 模型融合

最后将两个模型的结果取加权平均:

ens_train = 0.5*np.array(preds_train_xgb) + 0.5*np.array(preds_train_lin);
ens_val = 0.5*np.array(preds_val_xgb) + 0.5*np.array(preds_val_lin);
ens_test = 0.5*np.array(preds_test_xgb) + 0.5*np.array(preds_test_lin);

print("Training MSE", mean_squared_error(train_labels, ens_train)) 
print("Validation MSE", mean_squared_error(val_labels, ens_val))
print("Test MSE", mean_squared_error(test_target, ens_test))

Training MSE 0.1786694748626782
Validation MSE 0.2740073446434298
Test MSE 0.3336424287800188

以上即为使用SageMaker进行模型训练、部署、以及验证的过程。对此结果来看,后续仍需要做部分优化。

从数据方面,还可以考虑:

  1. 做Box-Cox 变换,使数据更符合正态分布,使其更加符合后面数据挖掘方法对数据分布的假设
  2. 可以尝试不同的PCA参数

从模型训练方面,还可以考虑:

  1. 对xgboost增加l2 正则惩罚,缓解过拟合
  2. 对模型使用更多的参数搜索
  3. 尝试更优的lightGBM、SVM等算法
  4. 增加Bagging的模型数目
  5. 尝试Stacking

 

posted @ 2021-04-10 03:10  ZacksTang  阅读(909)  评论(0编辑  收藏  举报