AI夏令营第三期 - 脑PET图像分析和疾病预测挑战赛

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<第一次更新> 2023.8.18 22:10

Backgound


赛事任务

为研究基于脑PET图像的疾病预测,本次大赛提供了海量脑PET数据集作为脑PET图像检测数据库的训练样本,参赛者需根据提供的样本构建模型,对轻度认知障碍进行分析和预测。

脑PET图像检测数据库,记录了老年人受试志愿者的脑PET影像资料,文件格式为.nii医学 \(3D\) 文件。

  • 轻度认知障碍(MCI)

  • 健康人(NC)

Pre


数据集包含训练集Train文件夹和测试集Test文件夹,其中Train文件夹下有MCI和NC两个部分,分别存放不同结果的测试数据。

统计方法Baseline方案先进行30次特征提取,然后喂给逻辑回归模型训练,随后进行测试集的预测以及转置增加结果数。最后用统计方法投票决定结果。

值得注意的是,提取的特征主要有8个,如图:

pPYGIjs.png

这些特征能代表图案的纹理、占比、边缘的性质,有一定的识别作用,最终获得的 \(f1\_score\) 大概在 0.5 左右



以上为 统计方法 baseline 方案的内容理解,作为第一次打卡的内容,此处为分割线。



Work


CNN Baseline 使用卷积神经网络的方法进行深度学习,该模型在图像数据的训练上表现出色。

准备

pip install opencv-python
pip install pillow
pip install tqdm
pip install torch
pip install torchvision

按提示下载即可。

cuda 根据自己电脑版本下载

nvidia-smi

运行

我没有成功,遇到了cuda版本和torch不兼容的问题,试过重下不同版本没有解决,网上可没找到可行方案,网上那些torch版本都太低了,没有参考性。

寄。

posted @ 2023-08-18 22:25  云烟万象但过眼  阅读(56)  评论(0编辑  收藏  举报