2017年3月26日
将基因组数据分类并写出文件，python，awk，R data.table速度PK
摘要： 由于基因组数据过大，想进一步用R语言处理担心系统内存不够，因此想着将文件按染色体拆分，发现python，awk，R 语言都能够非常简单快捷的实现，那么速度是否有差距呢，因此在跑几个50G的大文件之前，先用了244MB的数据对各个脚本进行测试，并且将其速度进行对比。 首先是awk处理，awk进行的是逐 阅读全文
posted @ 2017-03-26 10:01 ywliao 阅读(1880) 评论(0) 推荐(1) 编辑