annvar下载数据库的网址
背景
因为annovar默认的脚本下载数据库,总是中断,所以我选择用wget 下载
方法
比如想下载hg19_gwava数据,那么需要下载原始txt数据和idx文件,路径如下
http://www.openbioinformatics.org/annovar/download/hg19_gwava.txt.gz
http://www.openbioinformatics.org/annovar/download/hg19_gwava.txt.idx.gz
下载之后再解压就好了,像refGene(没有idx文件)这些都可以参照上面的下载下载
最后附上annovar可以下载的数据库的名称说明:https://annovar.readthedocs.io/en/latest/user-guide/download/