云中道长

摘要： 每次找都挺麻烦，又记不住，于是抄下来：blastp:将待查询的蛋白质序列及其互补序列一起对蛋白质序列数据库进行查询；blastn:将待查询的核酸序列及其互补序列一起对核酸序列数据库进行查询；blastx:先将待查询的核酸序列按六种可读框架（逐个向前三个碱基和逐个向后三个碱基读码）翻译成蛋白质序列，然后将翻译结果对蛋白质序列数据库进行查询；tblastn:先将核酸序列数据库中的核酸序列按六种可读框架翻译成蛋白质序列，然后将待查询的蛋白质序列及其互补序列对其翻译结果进行查询；tblastx:先将待查询的核酸序列和核酸序列数据库中的核酸序列按六种可读框架翻译成蛋白质序列，然后再将两种翻译结果从蛋白质 阅读全文

摘要： 如果出现以下错误：Warning Error Could not open blosum62.bla as a filename for read Blast matrixWarning Error Could not read Comparison matrix file in blosum62.blaWarning Error you have passed through NULL objects in trying to make TSM fromsequenceWarning Error Could not build ThreeStateModel from a single pr 阅读全文

摘要： 编译遇到错误如下error: conflicting types for ‘getline’/usr/include/stdio.h:671:20: note: previous declaration of ‘getline’ was here这是因为getline这个函数在库里面已经有了，所以要换个名字解决方法如下：在src文件夹里面：grep -nr 'getline' *发现再sqio.c里面定义了getline函数sed -i 's/getline/getlines/g' HMMer2/sqio.c然后再make all就搞定了 阅读全文