摘要：
生物信息学 GU也可以配对，即“wobble” pairing GU。 Hairpin发夹结构，最少不能少于3个碱基。没有配对 Bulge 单侧配对 Loop双侧配对 假结，游离的leading edge与hairpin相结合。大部分软件不考虑此结构。 表示RNA5种结构： 如果有假结，则环形图会有
阅读全文
posted @ 2019-12-25 15:36
YUANya
阅读(908)
推荐(0)
编辑
摘要：
生物信息学软件： NCBI：BLAST，设定k-mer 默认是全局比对，Blastn是局部比对。 PSI-BLAST最灵敏的BLAST，选中部分矩阵后在数据库中查找相应蛋白。 PHI-BLAST找氨基酸motif ，参数有-db 数据库，-query 输入文件，-cut输出文件 Ensembl模式生
阅读全文
posted @ 2019-12-25 15:29
YUANya
阅读(869)
推荐(0)
编辑
摘要：
生物医学大数据-医学数据结合AI&自动化 Eg：Image net：识别眼科疾病
阅读全文
posted @ 2019-12-20 15:19
YUANya
阅读(149)
推荐(0)
编辑
摘要：
生物医疗大数据 PBMC-密度梯度离心 基因组找variants与药物使用相关， Eg：健康管理 Eg：婴幼儿检测 药物基因组学 Eg：神经递质 Eg：糖尿病 Eg：cancer 药物筛查 Cancer治疗方法：1.化疗2.基因靶向治疗3.免疫疗法 癌症精准医疗的几个方面：1.癌症筛查2.药物筛选（
阅读全文
posted @ 2019-12-20 15:17
YUANya
阅读(230)
推荐(0)
编辑
摘要：
生物信息学的研究过程 数字化是指将生物信息提取为数据，并积累和整合。信息化是指经过数字化之后的数据放入算法模型当中进行计算和整合，智能化是指通过算法模型得到的信息之后，再经过信息挖掘能反馈出相应的应用信息并转化到应用层面。 生物信息三巨头： NCBI、EBI和BIG data center 国家生物
阅读全文
posted @ 2019-12-19 16:12
YUANya
阅读(672)
推荐(0)
编辑
posted @ 2019-12-19 16:10
YUANya
阅读(248)
推荐(0)
编辑
摘要：
蛋白质结构预测： 结构预测方法：4种 同源建模：HM目标，基于序列的方法 蛋白质线程：FR目标，序列-结构比对 从头算折叠方法：NF目标，建立结构而不引用现有结构 一致性方法：对由多个预测程序生成的某些候选人的预测进行投票 相互作用预测3种 蛋白质-蛋白质相互作用是指涉及相同的代谢途径或生物过程，或
阅读全文
posted @ 2019-12-19 16:09
YUANya
阅读(703)
推荐(0)
编辑
摘要：
关键期是指动物在发育过程中经历的一种神经可塑性变化时期，神经开始发育时可塑性较强，随着年龄和经验的增长可塑性逐步降低。 可以从五流的角度来证明关键期的存在。 从信息流来说，与唱歌感知有关的基因，对于幼年有唱歌训练的斑马雀来说，从幼年到成年的过程中该基因表达由高到低，即该基因表达与年龄有关，对于幼年没
阅读全文
posted @ 2019-12-19 16:07
YUANya
阅读(339)
推荐(0)
编辑
摘要：
简述影响多细胞生物基因组大小的各种因素，并尽力解释可能的原因和验证方案。 1.因素一：从操作流来说，剪切过程决定基因组大小。 1.1可能的解释：比如动物的剪切子比植物的更复杂也更为保守，其中动物剪切子上的增强子在exon中，而植物在intron中，所以动物剪切的内含子比植物多，即动物允许重复序列插入
阅读全文
posted @ 2019-12-19 16:04
YUANya
阅读(1169)
推荐(0)
编辑
摘要：
RNA组研究的困难何在？如果开发新技术来解决这些困难，您最想解决的科学问题是什么？ RNA研究的困难在于研究技术落后 (1)从信息流来说，我们需要直接测定RNA的序列，但是我们只能DNA测序仪间接测得。 (2)从操作流来说，我们需要直接测定修饰核苷酸在序列中的位置，但是逆转录成cDNA后就失去了修饰
阅读全文
posted @ 2019-12-19 16:03
YUANya
阅读(363)
推荐(0)
编辑
