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2019年7月18日

摘要: 2.2Organizing Qualitative Data The number of times a particular distinct value occurs is called its frequency (or count) Relative-Frequency Distributi 阅读全文
posted @ 2019-07-18 12:26 YUANya 阅读(335) 评论(0) 推荐(0) 编辑
 

2019年7月14日

摘要: 2.1Variables and Data Variable:某物或某人的某一特征和其他个体不同。 quantitative variables:定量变量either discrete (可以被数)or continuous.(A continuous variable is a variable 阅读全文
posted @ 2019-07-14 22:59 YUANya 阅读(438) 评论(0) 推荐(0) 编辑
 
摘要: 1.2 Simple Random Sampling Census, :全部信息 Sampling: 抽样方式: representative sample:有偏向,研究者选择自己觉得有代表性的sample probability sampling:使用随机数表不用研究者来抽样,较为客观(研究者可以 阅读全文
posted @ 2019-07-14 22:14 YUANya 阅读(327) 评论(0) 推荐(0) 编辑
 
摘要: descriptive statistics:组织和总结信息,为自身(可以是population也可以是sample)审视和探索, inferential statistics.从sample中推论population情况并评价推论可信度 在population中精挑细选出sample Observ 阅读全文
posted @ 2019-07-14 20:55 YUANya 阅读(344) 评论(0) 推荐(0) 编辑
 

2019年7月11日

摘要: a= 'eeekkksksksk' print a.replace('e','s').replace('s','k') #kkkkkkkkkkkk change={"e":"s","k":'@',"s":"!"} a_new=''.join(change[i] for i in a) print(a_new) ''' sss@@@!@!@!@ '' 阅读全文
posted @ 2019-07-11 21:09 YUANya 阅读(224) 评论(0) 推荐(0) 编辑
 
摘要: #!/usr/bin/python import re import sys import gzip change={'A':'T','T':'A','C':'G','G':'C','N':'N'} CODE = { 'GCA' : 'A', 'GCC' : 'A', 'GCG' : 'A', 'GCT' : 'A&# 阅读全文
posted @ 2019-07-11 21:01 YUANya 阅读(400) 评论(0) 推荐(0) 编辑
 
摘要: #!/usr/bin/python a=set([i for i in range(4,8)]) b=set([i for i in range(5,12)]) c= sorted(a & b) print c print reduce(lambda x,y:(x-1)*y,c) def func_1(x,y): return (x-1)*y print reduce(func_... 阅读全文
posted @ 2019-07-11 16:05 YUANya 阅读(158) 评论(0) 推荐(0) 编辑
 
摘要: #!/usr/bin/python from subprocess import check_call import subprocess import gzip ''' $ zcat 160121_I133_FCH5LL5BBXX_L8_RSZADPI007179-107_2.fq.gz |head -4 >o3 $ cat o3 @K00133:143:H5LL5BBXX:8:1101:1... 阅读全文
posted @ 2019-07-11 15:33 YUANya 阅读(182) 评论(0) 推荐(0) 编辑
 

2019年7月10日

摘要: #!/usr/bin/python import sys import getopt import re def compare(f1,f2,o1,o2,si_line): lines_count=0; in1 = open(f1,"r") in2 = open(f2,"r") ou1 = open(o1,"w") ou2 = open(o2,"w"... 阅读全文
posted @ 2019-07-10 16:34 YUANya 阅读(120) 评论(0) 推荐(0) 编辑
 
摘要: cd /xxx/genome_stat/Annotation ln -s /xxx/02.annotation/gff_v2/*.homolog.v2.gff /xxx/genome_stat/Annotation ls *.gff | while read l;do echo "perl /xxx/02.annotation/build_pipeline/bin/stat_gff.pl $l"... 阅读全文
posted @ 2019-07-10 16:28 YUANya 阅读(651) 评论(0) 推荐(0) 编辑
 
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