摘要:
病原微生物分析: Eg:痢疾杆菌 测序 比对(K12vs治病菌1vs治病菌2),发现: “毒力岛”:K12没有,两个治病菌有,缩小搜寻范围。 “黑洞”:K12有,但两个治病菌没有。 SARS: 构建系统发育树,发现由冠状病毒进化而来。 不同地区的SARS基因组比较,可溯源病毒传播 根据各SARS冠状
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posted @ 2019-11-20 11:32
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摘要:
四、基于序列数据的生物进化研究的挑战 解密后由表象进化到分子进化。 构建进化树的步骤: 序列相似性比较 序列同源性比较 构建系统进化树 稳定性检验,因为必须是保守序列。 序列相似性比较。就是将待研究序列与DNA或蛋白质序列库进行比较,用于确定该序列的生物属性,也就是找出与此序列相似的已知序列是什么。
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posted @ 2019-11-20 11:29
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三、完整基因组的比较研究 研究所有基因的排列,元件之间的相互关系。 人类的HOX gene是果蝇的HOX gene的4倍,说明演化过程中进行2次加倍。
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posted @ 2019-11-20 11:28
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生命组学 生命起源经过复杂演化诞生了大量生物体及其基因组。 现今NCBI最大的基因组: 植物:糖松27.6G 动物:墨西哥蝾螈32.4G 大数据能做什么? 大数据时代如同大航海时代一样,需要具有与时代对应的能力。 用于应对人类挑战:eg:环境暴露组数据 现在的研究模式:知识挖掘 算法模型 数据整合
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posted @ 2019-11-20 02:32
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posted @ 2019-11-18 20:38
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方差相同个数相同的独立t检验 5、某饲料厂要比较A、B两种配合饲料在养猪生产中的效果,选取12头情况相似的猪,随机分成两组,分别饲喂两种配合饲料,其60天增重(单位:kg)见下表。 饲 料 60d增重 A 21.5 25.0 31.0 23.4 24.5 23.6 B 35.0 34.4 37.8
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posted @ 2019-11-18 20:35
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零相关是什么? 零相关亦称“不相关”。相关的一种。两个变量的相关系数r=0时的相关。零相关表示两个变量非线性相关,这时两个变量可能相互独立,也可能曲线相关。对于正态变量,两个变量零相关与两个变量相互独立等价。对于一般情形,两个变量相互独立时一定零相关。 [1] 零相关即没有关系,变量x和y之间的关系
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posted @ 2019-11-18 20:29
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直线相关与回归分析 双变量计量资料中的总体是什么? 是所有的变量,每一个变量是一个变量值组(a,b)。 协变关系是什么? 一个变量变化之后另外一个变量跟着变化。 平行关系在哪里? 散点图中的正向协同变化是什么?散点图中的负向协同变化是什么? 都是两个变量之间关系的定性描述: 定量描述是:相关和回归
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posted @ 2019-11-18 20:25
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修正: 样本统计数和样本统计量之间的关系是什么? 样本统计量是一个变量,而样本统计数是该变量对应的数值。样本统计量也是样本统计数,参数也是参量。 生物统计学和统计学都包含两部分是什么? 统计学的基本内容包括(统计描述)和(统计推断)两大部分。 生物统计学的基本内容包括(试验设计)和(统计分析)两大部
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posted @ 2019-11-18 20:14
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卡方检验独立性检验: 2、某生物药品厂制造一批新的疫苗,为检验其免疫力,用200只鸡进行试验,其中注射100只(经注射后患病的10只,不患病的90只),对照组(注射原疫苗组)100只(经注射后患病的15只,不患病的85只),试问新旧疫苗的免疫力是否有差异。 (已知;结果保留两位小数) 2、H0:发病
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posted @ 2019-11-18 20:08
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