摘要:
生物信息学的研究过程 数字化是指将生物信息提取为数据,并积累和整合。信息化是指经过数字化之后的数据放入算法模型当中进行计算和整合,智能化是指通过算法模型得到的信息之后,再经过信息挖掘能反馈出相应的应用信息并转化到应用层面。 生物信息三巨头: NCBI、EBI和BIG data center 国家生物 阅读全文
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蛋白质结构预测: 结构预测方法:4种 同源建模:HM目标,基于序列的方法 蛋白质线程:FR目标,序列-结构比对 从头算折叠方法:NF目标,建立结构而不引用现有结构 一致性方法:对由多个预测程序生成的某些候选人的预测进行投票 相互作用预测3种 蛋白质-蛋白质相互作用是指涉及相同的代谢途径或生物过程,或 阅读全文
摘要:
关键期是指动物在发育过程中经历的一种神经可塑性变化时期,神经开始发育时可塑性较强,随着年龄和经验的增长可塑性逐步降低。 可以从五流的角度来证明关键期的存在。 从信息流来说,与唱歌感知有关的基因,对于幼年有唱歌训练的斑马雀来说,从幼年到成年的过程中该基因表达由高到低,即该基因表达与年龄有关,对于幼年没 阅读全文
摘要:
简述影响多细胞生物基因组大小的各种因素,并尽力解释可能的原因和验证方案。 1.因素一:从操作流来说,剪切过程决定基因组大小。 1.1可能的解释:比如动物的剪切子比植物的更复杂也更为保守,其中动物剪切子上的增强子在exon中,而植物在intron中,所以动物剪切的内含子比植物多,即动物允许重复序列插入 阅读全文
摘要:
RNA组研究的困难何在?如果开发新技术来解决这些困难,您最想解决的科学问题是什么? RNA研究的困难在于研究技术落后 (1)从信息流来说,我们需要直接测定RNA的序列,但是我们只能DNA测序仪间接测得。 (2)从操作流来说,我们需要直接测定修饰核苷酸在序列中的位置,但是逆转录成cDNA后就失去了修饰 阅读全文
摘要:
如何在转录水平分类所有RNA分子?可以罗列所有的可能性、技术策略和终极目标。 可能性:见纸 技术策略:RNA单细胞直测技术 终极目标:单细胞水平RNA直测技术决定新的人类RNA组和人类表观组学两个核心计划的启动 具体而言是建立细胞RNA组(实现免扩增和全部RNA的定量)、建立单细胞RNA组(逾两百种 阅读全文
摘要:
植物vs动物总结版: 简述高等植物基因组(可以以拟南芥和水稻基因组为例)与高等动物基因组(可以以人类、果蝇等基因组为例)在基因结构层面展示出来的基本差异。 高等植物基因组与高等动物基因组在基因结构上的基本差异主要是生命组学的第一困境,即复制-转录负载困境。 机制: 1.从平衡流看, 1.1高等植物基 阅读全文