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2019年6月20日

摘要: 建立二维数组方式二: 阅读全文
posted @ 2019-06-20 21:23 YUANya 阅读(917) 评论(0) 推荐(0) 编辑
 
摘要: (测序方面):测三只大熊猫;得到的insert size有150bp,500bp,2kb,5kb和10kb这四种,可测得序列长度和平均reads长度。 为什么average reads这么短? 因为insert size是打断前的长度,打断之后便是reads,这里计算average reads长度。 阅读全文
posted @ 2019-06-20 19:30 YUANya 阅读(585) 评论(0) 推荐(0) 编辑
 
摘要: (组装方面):SOAPdenovo ,因为采用de Bruijn graph algorithm算法和stepwise strategy ,所以排错能力高,所以我们获得高质量数据。 de Bruijn graph algorithm算法???? reads到contig :多个reads比对,比对后 阅读全文
posted @ 2019-06-20 19:14 YUANya 阅读(467) 评论(0) 推荐(0) 编辑
 
摘要: Needleman_Wunsch算法思路:1.建立二维数组2.建立评分模式load1:向右;-2load2:向下;-2load3:对角线;依据是否配得到匹配:+1不匹配:-13... 阅读全文
posted @ 2019-06-20 01:28 YUANya 阅读(136) 评论(0) 推荐(0) 编辑