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看到知乎一篇介绍这几种富集分析的文章 搬运一下 留着以后不记得的时候拿出来瞧瞧 小白刚接触，真的是有点傻傻分不清 https://zhuanlan.zhihu.com/p/395178020 阅读全文
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转载自 https://www.jingege.wang/2022/10/12/tcga%e7%9a%84%e6%a0%b7%e6%9c%ac%e5%91%bd%e5%90%8d%ef%bc%88barcode%ef%bc%89%e8%af%a6%e8%a7%a3/ 阅读全文
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mRNA、lncRNA 和 miRNA 的核心区别 三者均为 RNA 分子，但在结构、功能和生物学作用上有显著差异： 1. mRNA(信使RNA) 功能 ： 将 DNA 的遗传信息转录后传递至核糖体，指导蛋白质合成（基因表达的核心步骤）。 结构 ： 单链线性结构，长度通常为数百至数千个核苷酸（nt） 阅读全文
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乳腺癌亚型（Breast Cancer Subtype） 是指根据乳腺癌的分子特征、病理特征或临床表现，将乳腺癌患者划分为不同类别的分类方法。不同亚型的乳腺癌在生物学行为（如生长速度、侵袭性）、治疗反应和预后（生存率）上存在显著差异。分型的目的是为患者提供更精准的诊断、预后评估和个体化治疗方案。 1 阅读全文
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https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352304225000789?via%3Dihub 1.研究背景和理论基础 现有分类方法的局限性 当前乳腺癌分类（如PAM50亚型）依赖少数标记基因或蛋白的表达，无法充分捕捉样本间共同的生物学特 阅读全文
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1. TCGA 背景 TCGA （The Cancer Genome Atlas，癌症基因组图谱）是美国国家癌症研究所（NCI）和国家人类基因组研究所（NHGRI）联合发起的大型癌症研究计划（2006-2018）。其目标是通过高通量组学技术（如基因组、转录组、表观组等），系统解析癌症的分子特征，为精 阅读全文
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1.基本概念 T检验 是一种统计学方法，用于判断两组数据的均值是否存在显著差异 。其核心思想是通过计算“t值”和对应的“p值”，评估观察到的差异是否由随机误差引起，还是反映了真实的生物学或实验效应。 适用场景 ： 比较两组独立样本的均值（如对照组 vs 实验组）。 检验单组数据的均值是否与已知理论值 阅读全文
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1.基本概念 WGCNA 是一种基于基因表达数据的系统生物学方法，通过构建基因共表达网络，识别高度协同表达的基因模块（Module，并探索这些模块与表型（如疾病、生理特征）之间的关联。其核心思想是：“共表达的基因可能在功能上相关” 。 基因共表达网络 ：以基因表达数据为基础，计算基因间的表达相关性（ 阅读全文
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1.KEGG的基本概念 KEGG是一个整合基因、通路、疾病和药物信息的综合数据库，旨在系统地解析基因与基因组的功能。其核心内容是KEGG通路（Pathway） ，通过手工绘制的分子相互作用网络图（如代谢通路、信号转导通路等），将基因、蛋白质、化合物的功能联系起来。 KEGG通路分为以下几类： 代谢通 阅读全文
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1.基本概念 基因本体论（Gene Ontology，GO） 是一个国际标准化的基因功能分类系统，旨在统一描述基因或蛋白质在生物体中的功能。它通过三个独立的本体（Ontology）对基因功能进行分类： 生物过程（Biological Process, BP） ：描述基因参与的生物学活动，例如“细胞分 阅读全文
