文章分类 -  基因组

摘要：介绍KmerGenie，用KmerGenie做基因组调查(genome survey)的k-mer频数统计和基因组特征评估。 阅读全文

摘要：介绍GCE，用GCE的kmerfreq做基因组调查(genome survey)的k-mer频数统计，GCE的gce做基因组特征评估。 阅读全文

摘要：介绍GenomeScope，用GenomeScope做基因组调查(genome survey)的基因组特征评估。用GenomeScope1.0评估二倍体物种的基因组大小、杂合度、重复率等基因组特征，用GenomeScope2.0评估多倍体物种的基因组大小、杂合度、重复率、基因型比例和基因组结构(同源/异源多倍体)等基因组特征，用Smudgeplot估计物种的倍性。 阅读全文

摘要：介绍KMC，用KMC做基因组调查(genome survey)的k-mer频数统计。 阅读全文

摘要：介绍jellyfish，用jellyfish做基因组调查(genome survey)的k-mer频数统计。 阅读全文

摘要：基因组调查(genome survey)的概念和方法，k-mer分析的原理，利用k-mer分析来进行基因组调查（估计基因组大小，杂合度，重复序列占比等基本信息），以及简介做基因组调查的软件。 阅读全文