随笔分类 -  making_pic

氨基酸保守性的着色
摘要：网上有vmd进行原子数值着色方法的教程，格式要求较为严格，譬如，原子序号与数值全部对应，数值只能是一列数据。其实，可以不必要求这么严格的格式，只要有原子与数值对应关系即可。这里采用数值替换氨基酸的B-factor数据的例子，然后在chimera中采用render by attribute显示。 该例... 阅读全文

posted @ 2014-10-23 16:07 原生態 阅读(923) 评论(0) 推荐(0)

circos---基因分布
摘要：http://circos.ca/guide/ 阅读全文

posted @ 2013-12-30 20:04 原生態 阅读(351) 评论(0) 推荐(0)

R语言---热图的制作
摘要：>install.packages("gplots") > library("gplots")> p <- data.frame(read.table("test.txt",header = T, sep="\t"))> row.names(p) <- p$gene> p <- p[,2:21]> 阅读全文

posted @ 2013-11-08 17:04 原生態 阅读(1581) 评论(0) 推荐(0)