摘要: 1.bioMart包的介绍 bioMart包是一个连接bioMart数据库的R语言接口,能通过这个软件包自由连接到bioMart数据库,这个包可以做以下几个工作: 1.查找某个基因在染色体上的位置。反之,给定染色体每一区间,返回该区间的基因; 2.通过EntrezGene的ID查找到相关序列的GO注 阅读全文
posted @ 2019-12-17 15:40 sryjm 阅读(16957) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: liftover的介绍 人类基因组有不同的版本,目前用的最多的是hg38和hg19,为了将不同版本的染色体上的位置一一对应,UCSC出了这款工具liftOver,官方的定义是: This tool converts genome coordinates and genome annotation f 阅读全文
posted @ 2019-12-10 21:51 sryjm 阅读(7260) 评论(1) 推荐(0) 编辑