摘要：1.使用clusterProfiler包进行GO富集分析 使用clusterProfiler的enrichGO函数来获取GO分析 gene_id<-read.csv("SFTSV_24vscontrol_DE_mRNA.csv",header=T,stringsAsFactors = F)[,2] 阅读全文

摘要：散点图是 KEGG 富集分析结果的图形化展示方式。在此图中，KEGG 富集程度通过 rich factor, qvalue 和富集到此通路上的基因个数来衡量。其中 rich factor 指差异表达的基因中位于该 pathway 条目的基因数目与所有有注释基因中位于该 pathway 条目的基因总数 阅读全文

摘要：KOBAS的介绍 KOBAS是北大生物信息中心研发的一个网页工具，用来基因/蛋白功能注释(注释模块)和功能基因集富集(富集模块)。以下是KOBAS的英文介绍： KOBAS 3.0 is a web server for gene/protein functional annotation (Anno 阅读全文

摘要：Novel LncRNA的选择 novel LncRNA选择的原则： 1.不能选与其他基因exon重叠的lncRNA，否则，RT-qPCR结果就混合了两个基因的表达量。 2.最好选择基因间的lncRNA，即lincRNA，跟其他基因没有重叠。 3.其次选择位于其他基因intron区域的lncRNA。 阅读全文

摘要：LncRNA设计原则 LncRNA的引物设计跟mRNA的引物设计类似，都遵循以下规则： 1.引物应在核酸系列保守区内设计并具有特异性。2.扩增产物长度在 80-150bp。最长不要超过 300bp。3.产物不能形成二级结构(自由能小于 58.61KJ/mol)。4.引物长度:一般在 17-25 碱基 阅读全文