python文件操作

摘要: 最基本的文件操作当然就是在文件中读写数据。这也是很容易掌握的。现在打开一个文件以进行写操作:1. fileHandle = open ( 'test.txt', 'w' )fileHandle = open ( 'test.txt', 'w' )‘w'是指文件将被写入数据,语句的其它部分很好理解。下一步就是将数据写入文件:1. fileHandle.write ( 'This is a test.\nReally, it is.' )fileHandle.write ( 'This is a tes 阅读全文
posted @ 2012-08-30 13:54 yangyzh 阅读(383) 评论(0) 推荐(0) 编辑

rnnotator,scripture跑不通

摘要: 可能原因:1:环境变量的问题 检查该装的软件是不是装齐了,所装软件的位子对不对,可不可以直接调用的等等; 检查所装的模块是不是适合的版本; 2:程序本身的问题 由于程序的要求不同,它是别的所需软件的路径不同。由perl或python编写的软件,有时所需路径要求十分苛刻,这是就要修改路径,将不同的软件路径改为合适的路径。 阅读全文
posted @ 2012-08-30 10:16 yangyzh 阅读(204) 评论(0) 推荐(0) 编辑

BED文件格式

摘要: BED文件格式BED文件格式是一个可变方式的数据线,用来描述注释的数据。BED线有3个要求的字段和9个额外的字段。每条线的字段数目必须是任意单条数据的在注释上一致。可选字段的序试结合低数字的字段必须流行如果高位字段被使用。首先是三个要求的BED字段chrom,染色体或scafflold的名字(eg chr3,chrY, chr2_random, scaffold0671 )chromStart染色体和scaffold的起始位置,第一个染色体的位置是0chromEn染色体和scaffold的结束位置,染色体的末端位置没有包含到显示信息里面。例如,首先得100个碱基的染色体定义为chromStar 阅读全文
posted @ 2012-08-30 09:56 yangyzh 阅读(3675) 评论(0) 推荐(0) 编辑

Python运行的17个时新手常见错误小结

摘要: http://www.jb51.net/article/31014.htm 阅读全文
posted @ 2012-08-27 15:54 yangyzh 阅读(197) 评论(0) 推荐(0) 编辑