第二章 基因芯片
DNA微阵列
DNA微阵列(DNA microarray)又称DNA阵列、DNA芯片和基因芯片(gene chip),是一块数平方公分面积布放数千或数万个核酸探针的特殊玻璃片或硅芯片。
检体中的DNA、cDNA或RNA与探针结合后,借由荧光或电流等方式侦测,即可提供大量基因序列信息。研究人员应用基因芯片可以在同一时间定量分析大量(成千上万)的基因表达,具有快速、精确、低成本的检验能力,是基因组学和遗传学研究常用的工具。
原理
微阵列背后的核心原理是将两条DNA链之间杂交,互补的核苷酸碱基之间配对形成氢键。
商业化芯片种类
DNA微阵列(DNA-microarray):检测样本的genomic DNA,作为基因型别鉴定之检测。
cDNA微阵列(cDNA-microarray):或称expression array,将样本中的mRNA转为cDNA后进行检测,作为基因表达程度之检测与比较。
miRNA微阵列(miRNA-microarray):检测miRNA相关的基因调控机制。
ChIP-chip:chromatin immunoprecipitation on chip
高通量核酸定序芯片:合并特殊PCR反应及微阵列侦测技术转作为基因定序之用。
临床检测微管芯片:将低密度微阵列附于特制检验管底部,用以检测特定病原或癌症指标的试剂组。
CGH芯片:染色体芯片(array Comparative Genomic Hybridization,aCGH或称Chromosomal Microarray Analysis,CMA)
SNP芯片:可检测基因多型性(Polymorphisms)。
基因甲基化芯片:检测DNA被甲基化修饰程度。