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随笔分类 -  Linux

Linux服务器,Shell编程资源、技巧
摘要:准备 首先,你需要准备一个VPN 这里我用的是Vultr,你也可以上AWS日本申请个免费试用一年的EC2 VPS,或是Linode买个一月USD10刀的VPS,然后自建一个PPTP的VPN。 然后,搭建ss服务 服务搭建 执行后,会提示输入源码语言,密码、端口、及加密方式等。(笔者这里端口使用898 阅读全文
posted @ 2019-08-19 00:23 青蛙快飞 阅读(19) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:在Ubuntu系统中,执行命令apt-get install -y tzdata以安装tzdata软件包。但是,最近发现,在Ubuntu 18.04 (Bionic Beaver)上无法自动安装该软件包,这里的tzdata版本为2018d-1。 在tzdata 2017的各个版本中(如2017c), 阅读全文
posted @ 2019-06-23 11:43 青蛙快飞 阅读(7603) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:转载 https://jingyan.baidu.com/article/e2284b2b99a327e2e6118d38.html 打开Windows下 设置--更新和安全--针对开发人员--选中“开发人员模式” 启用 “适用于Linux的Windows子系统” 打开控制面板--程序 启用或关闭W 阅读全文
posted @ 2019-05-18 16:53 青蛙快飞 阅读(405) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:1:将U盘插入USB接口,检查是否插好 2:用fdisk命令检查分区和USB设备信息 通过上面信息我们可以看出USB设备是FAT32格式的,标识为/dev/sdb1 3:在mnt目录下先建立一个usb的目录 4:挂载U盘 挂载成功后,我们可以在/mount/usb下看到相关的内容。 注意:有时候挂载 阅读全文
posted @ 2019-05-05 10:19 青蛙快飞 阅读(1009) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:1. 修改 /etc/timezone的时钟为UTC时钟. 2.修改时区 3.同步时钟服务器 报错 21 Feb 03:04:30 ntpdate[19759]: the NTP socket is in use, exiting 解决方法,停止npdd服务 4.写入BIOS https://blo 阅读全文
posted @ 2019-04-26 10:33 青蛙快飞 阅读(7576) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:1.启动镜像并做出修改 docker run -it centos /bin/bash [root@afcaf46e8305 /]# 注意afcaf46e8305是产生的容器ID,前面运行的时候不要-d后台运行了,不然无法进入容器交互执行模式: 安装vim并且退出容器: yum install -y 阅读全文
posted @ 2019-04-10 16:59 青蛙快飞 阅读(3016) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:在Dockerfile中添加 原文链接 https://www.jianshu.com/p/c1885cc192a6 阅读全文
posted @ 2019-04-10 16:04 青蛙快飞 阅读(1509) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:转载 https://jingyan.baidu.com/article/ed2a5d1f98577809f6be17a3.html 打开终端界面,在这个窗口测试一下ls命令,无误。 在Cortana中搜索远程桌面连接,点击进入,输入本机IP:端口,以及子系统用户名(在步骤2中,终端窗口@符号之前) 阅读全文
posted @ 2019-03-29 16:01 青蛙快飞 阅读(11498) 评论(1) 推荐(0) 编辑
摘要:Ubuntu系统中可输入如下命令,安装开发环境: https://blog.csdn.net/yygydjkthh/article/details/41787049 阅读全文
posted @ 2019-03-29 09:25 青蛙快飞 阅读(5762) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:1.conda安装 在https://repo.continuum.io/miniconda/选择conda版本 2.添加镜像源 3.添加国内镜像源 4.创建新环境 5.删除新环境 6.重命名环境 阅读全文
posted @ 2019-03-28 09:59 青蛙快飞 阅读(9289) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:报错如下: 解决办法: In /var/lib/dpkg/info/,find file like docker.io.*,and delete them all,then redo the remove action,it will be ok. I just remove the openssh 阅读全文
posted @ 2019-03-27 13:21 青蛙快飞 阅读(5347) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:1. gcc源码下载 ftp://gcc.gnu.org/pub/gcc/releases/ 下载你所需要的GCC版本。 2. 下载gcc依赖库源码 gmp ftp://gcc.gnu.org/pub/gcc/infrastructure/gmp-6.1.0.tar.bz2 mpc ftp://gc 阅读全文
posted @ 2018-09-30 13:17 青蛙快飞 阅读(6342) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:Gnuplot是一个用C编写的用于生成二维和三维图命令行程序,对于脚本驱动的图形,gnuplot是迄今为止最受欢迎的程序。在Centos安装gnuplot,如下所示: 在运行一些生物信息软件的时候,提示:Could not find/open font when opening font “aria 阅读全文
posted @ 2018-09-18 16:00 青蛙快飞 阅读(2496) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:在生信处理流程中,从最初的fastq文件,经过分析处理后,会生成一堆的后续文件,如何在流程中合理的命名呢? 通常在批处理模式中,我们会得到多个样本*.fastq(或*.fq、*.fastq.gz、*.fq.gz)路径名文件sample.txt。如下所示: 上述,是一个多个双端*.fastq全路径文件 阅读全文
posted @ 2018-09-17 18:56 青蛙快飞 阅读(3194) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:useradd具体参数 useradd创建的账户的默认值 1)新用户添加到GID为100的公共组 2)新用户的HOME目录将会位于/home/username 3)新用户账户密码在过期后不会被禁用 4)新用户账户未被设置为某个日期后就过期 5)新用户账户将bash shell作为默认shell 6) 阅读全文
posted @ 2018-09-14 10:21 青蛙快飞 阅读(495) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:isPCR是用一对PCR引物搜索序列数据库。它使用索引策略来快速完成此操作。当搜索成功时,输出是fasta格式序列文件,其包含数据库中位于引物对之间的所有区域。 Linux系统下安装 1. 使用二进制文件 isPCR提供linux二进制执行文件,执行时报错缺少"lib.so.6"库文件。 安装ope 阅读全文
posted @ 2018-08-29 11:56 青蛙快飞 阅读(766) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:如何计算每个基因的覆盖度与深度,有多种方法可以完成。如下演示使用samtools depth命令方法 1. 数据下载 1.1 Fastq文件下载 从NCBI下载Illumina Hiseq X Ten平台的RNA-Seq数据SRR7751429信息如上图所示。 1.1.1 使用wget命令(sra- 阅读全文
posted @ 2018-08-26 09:57 青蛙快飞 阅读(10034) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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