从我的经验谈谈MyISAM、InnoDB、BDB三种数据表的优缺点

MyISAM
优点：速度快，磁盘空间占用少；某个库或表的磁盘占用情况既可以通过操作系统查相应的文件（夹）的大小得知，也可以通过SQL语句SHOW TABLE STATUS查得
缺点：没有数据完整性机制，即不支持事务和外键

InnoDB
优点：支持事务和外键，数据完整性机制比较完备；可以用SHOW TABLE STATUS查得某个库或表的磁盘占用
缺点：速度超慢，磁盘空间占用多；所有库都存于一个（通常情况）或数个文件中，无法通过操作系统了解某个库或表的占用空间

BDB
优点：支持事务，不支持外键，由于在事务支持的基础上，外键可以在数据库的客户端（可能是最终客户的服务器端，例如php）间接实现，所以数据完整性仍然是有保障的；
缺点：速度慢，磁盘占用多；不能通过SHOW TABLE STATUS查询某个库或表的空间占用；用操作系统可了解库相应的文件夹，或表相应的文件的大小，但由于BDB表总是还要产生log文件，而实际的磁盘占用应该把log文件也包含在内，所以用操作系统查得某库或表的大小总是小于实际占用空间。