谱聚类Ng算法的Matlab简单实现
请编写一个谱聚类算法,实现“Normalized Spectral Clustering—Algorithm 3 (Ng 算法)”
结果如下
谱聚类算法核心步骤都是相同的:
•利用点对之间的相似性,构建亲和度矩阵;
•构建拉普拉斯矩阵;
•求解拉普拉斯矩阵最小的特征值对应的特征向量(通常舍弃零特征所对应的分量全相等的特征向量);
•由这些特征向量构成样本点的新特征,采用K-means等聚类方法完成最后的聚类。
采用K-means等聚类方法完成最后的聚类 意思是,对特征向量构成的矩阵T,每一行作为一个样本点,进行K均值聚类。
(1)利用点对之间的相似性,构建亲和度矩阵,
构建图时,顶点的度为 simK=10,分两类kNearNum=2
simK=10; Wij=zeros(r,r);% weight % calculate the weight Matrix for k=1:r for n=1:r Wij(k,n)=exp(-norm(X(k,:)-X(n,:))^2/2/sigma);% 计算权重 end end % find the Knear for W Wsort=zeros(r,r); index=zeros(r,r); for k=1:r % 对每一行权重排序 [Wsort(k,:),index(k,:)]=sort(Wij(k,:)); %这句话经常不会用,记住了。 end W=Wij
首先需要个对角阵D,其对角元素是亲和度矩阵的每行的和,这里也就是simK*eye(r)
% D D=simK.*eye(r); % Laplace Matrix L=eye(r)-D^(-0.5)*W*D^(-0.5); % L=D-W
(3) 求解拉普拉斯矩阵最小的特征值(lamda)对应的特征向量)(通常舍弃零特征所对应的分量全相等的特征向量);
把特征向量 Vect里最小的kNearNum(聚类的个数)个用u来存储。
[Vect,lamdaMat]=eig(L); lamda=zeros(k,1); u=zeros(r,kNearNum); % lamda是特征值 for k=1:r lamda(k)=lamdaMat(k,k); end % lamda % 对lamda排序,找出最小的K个lamda对应的特征向量组成u [sortLamda,indexLamda]=sort(lamda); countu=0; for k=1:kNearNum countu=countu+1; u(:,countu)=Vect(:,indexLamda(k)); end % % T T=zeros(r,kNearNum);% 归一化后的u sumU=zeros(1,kNearNum);% 为了归一化u,对每列求了平方和sumU for n=1:kNearNum for k=1:r sumU(1,n)=sumU(1,n)+u(k,n)^2; end end for k=1:r for n=1:kNearNum T(k,n)=u(k,n)./sqrt(sumU(1,n)); end end
(4)由这些特征向量构成样本点的新特征,采用K-means等聚类方法完成最后的聚类
意思是,对特征向量构成的矩阵T,每一行作为一个样本点聚类
A=Kmeans(T) % key words
Kmeans详见下面链接