庐州月光

摘要： adj 用来控制文字的对齐方式，取值范围为0到1，控制图片中x轴和y轴标签，标题，以及通过text 添加的文字的对齐方式 0表示左对齐，代码示例： 效果图如下： 0.5为默认值，表示居中对齐，代码示例： 效果图如下： 1代表右对齐，代码示例： 效果图如下: 阅读全文

摘要： 在做microRNA 和 mRNA 相互作用预测的时候，大家都知道microRNA 作用的靶点是位于mRNA 的3'UTR取，所以只需要提取mRNA 对应的3'UTR 区的序列去做分析即可； 那么如何提取一个mRNA的3'UTR区呢？ 在UCSC数据库中，提供了3'UTR区序列的下载，以人类hg19 阅读全文

摘要： 研究人员针对 PTEN 这个关键的抑癌基因，来探究调控该基因表达的ceRNA 网络； 分析策略： 1）预测能调控该基因的miRNAs 通过miRanda 软件预测和实验验证相结合的方式，挑选出 miR-17-5p, miR-19a,miR-19b, miR-20a, miR-20b, miR-26a 阅读全文

摘要： ceRNA 不同于mRNA, lncRNA, ncRNA 等概念，其指的既不是某一种类型的RNA(比如mRNA, lncRNA), 也不是某一类的RNA(如ncRNA); ceRNA 其实指的是不同种类的RNA之间的调控机制，英文名为 competing endogenous RNA , 翻译成中文 阅读全文

摘要： circpedia 中收录了利用circexplorer 软件识别到的circRNA， 覆盖了人，小鼠，鸟类，昆虫多个物种的多种细胞系的数据 官网链接如下： http://www.picb.ac.cn/rnomics/circpedia/about 对于circRNA的来源基因(通常又叫做paren 阅读全文

摘要： 严格意义上将symbols 并不能算是一个低级的绘图函数，因为它不仅可以在一幅已经存在的图标上添加元素，还可以创建一张新的图表 鉴于它绘图时的灵活性，我把它归入到低级绘图函数中 symbols 可以创建包括圆形， 正方形，矩形，箱线图，类似温度计的图形在内的多种图形 基本用法： 通过x和y坐标指定要 阅读全文

摘要： grid 函数用来在一张图表上添加网格线， 基本用法：默认在添加刻度线的地方添加网格线 效果图如下： lwd : 设置网格线的宽度 代码示例： 效果图如下： lty : 网格线的类型，默认为虚线 代码示例： 效果图如下： col : 网格线的颜色，默认为 lightgray 代码示例： 效果图如下： 阅读全文

摘要： axis函数用来在一张图表上添加轴线，区别于传统的x轴和y轴，axis 允许在上，下，左， 右4个方向添加轴线 以x轴为例，一条轴线包含3个元素，水平的一条横线，叫做axis line , 刻度线， 叫做tick line, 对应的标签 labels 基本用法： 通过side 参数设置需要添加的轴线 阅读全文

摘要： title 函数用来在一张图表上添加标题 基本用法： main 表示主标题，通常位于图像的上方， sub 表示副标题，位于图像的下方， xlab 表示x轴的标签，ylab 表示y轴的标签 效果图如下： 参数设置： col : 设置标题的颜色 cex : 设置标题的文字大小 font : 设置标题的文 阅读全文

摘要： points 用来在一张图表上添加点，指定好对应的x和y坐标，就可以添加不同形状，颜色的点了； 基本用法： 通过x和y设置点的坐标 效果图如下： 参数设置： cex : 设置点的大小 代码示例： 效果图如下： lwd : 设置点的边框的宽度 代码示例： 效果图如下： pch ： 设置点的形状，取值范 阅读全文