2017年3月6日

ggplot2 multiply graphs on one figure
摘要： library(ggplot2)library(grid)grid.newpage()pushViewport(viewport(layout = grid.layout(1,2)))vplayout = function(x, y) viewport(layout.pos.row = x, lay 阅读全文
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manhattan plots in qqplot2
摘要： ###manhattan plots in qqplot2library(ggplot2)setwd("~/ncbi/zm/XPCLR/")read.table("LW.gene.xpclr.position.txt",header=F,sep=',')->ILhead(IL)#V1 V2 V3 V 阅读全文
posted @ 2017-03-06 01:00 Vermont 阅读(313) 评论(0) 推荐(0)

2017年1月13日

Simple python code for sorting the gff file by position
摘要： import sysinfile = sys.argv[1]outfile = sys.argv[2]gff_list = []fh = open(infile)for x in fh: if x[0] == '#': continue y = x.strip().split('\t') gff_l 阅读全文
posted @ 2017-01-13 01:05 Vermont 阅读(122) 评论(0) 推荐(0)
ggplot for geom_line
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2016年12月4日

perl array
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posted @ 2016-12-04 08:02 Vermont 阅读(14) 评论(0) 推荐(0)

2016年12月3日

R making predictions from lm
摘要： #using R #Prepare simulation data: a <- 1:5 b <- a^2 #predicting model model <- lm(b~poly(a,2,raw=T)) predicted <- predict(model,data.frame(x=a),inter 阅读全文
posted @ 2016-12-03 06:05 Vermont 阅读(116) 评论(0) 推荐(0)

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