摘要: 鼠Q Exactive HF-X Thermo Scientific 四极杆-轨道阱混合型TM质谱仪Q Exactive HF-X LTQ Orbitrap Velos 第一次选的参数不对,选的库也不对,库选得Mus musculus 第二次改了改成homo 阅读全文
posted @ 2022-05-21 21:34 十年后一起潇 阅读(50) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 如果您没有时间阅读这个简短的教程,以下是最重要的注意事项: 您无法搜索原始数据; 它必须转换为峰值列表。 搜索参数很关键,应该通过运行标准来确定,例如 BSA 摘要。 如果您不确定要搜索哪个数据库,请从 Swiss-Prot 开始。 如果您使用分类过滤器或搜索单个生物数据库,请在搜索中包含污染物数据 阅读全文
posted @ 2022-05-21 17:48 十年后一起潇 阅读(239) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 介绍 序列查询,其中一个或多个肽分子 质量与序列、组成和碎片离子相结合 数据,可能是最强大的搜索。 通常 序列信息的来源是解释 MS/MS 谱图。 虽然很难确定一个完整的 和来自 MS/MS 光谱的明确肽序列,它是 通常可以找到一系列提供 3 或 4个可靠序列数据的残基。 这种通用方法是由 Mann 阅读全文
posted @ 2022-05-21 17:39 十年后一起潇 阅读(961) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 如果您没有时间阅读这个简短的教程,以下是最重要的注意事项: 您无法搜索原始数据; 它必须转换为峰值列表。 搜索参数很关键,应该通过运行标准来确定,例如 BSA 摘要。 如果您不确定要搜索哪个数据库,请从 Swiss-Prot 开始。 如果您使用分类过滤器或搜索单个生物数据库,请在搜索中包含污染物数据 阅读全文
posted @ 2022-05-21 17:04 十年后一起潇 阅读(196) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Mascot 使用基于概率的评分。 这使得一个简单的 用于判断结果是否显着的规则。 使用质量值(肽质量或 MS/MS 碎片离子质量)进行匹配 总是按概率处理 基础。 总分是观察到的匹配是 随机事件。 直接报告概率可能会令人困惑。 部分原因是他们 包含非常广泛的量级,并且还因为“高”分数是 “低”概率 阅读全文
posted @ 2022-05-21 16:47 十年后一起潇 阅读(420) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 说明:此篇笔记系2016-2017年由克里克学院与康昱盛主办的蛋白质组学网络大课堂整理而成,侵删。该课程由上海易算生物科技有限公司CEO沈诚频博士所授。 主要知识点: --DIA数据非依赖性采集 --搜库原理及技巧 --蛋白质组学相关的数据库及使用方法 --总结 DIA数据非依赖采集 在上一篇推文, 阅读全文
posted @ 2022-05-21 16:24 十年后一起潇 阅读(1364) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 说明:此篇笔记系2016-2017年由克里克学院与康昱盛主办的蛋白质组学网络大课堂整理而成,侵删。该课程由上海易算生物科技有限公司CEO沈诚频博士所授。 主要知识点: --同位素对质谱分析的影响 --原始谱图的处理 --什么是b-y离子 回顾 image 在接着讲今天的关键问题之前,我们先来列一下质 阅读全文
posted @ 2022-05-21 15:55 十年后一起潇 阅读(1373) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 说明:此篇笔记系2016-2017年由克里克学院与康昱盛主办的蛋白质组学网络大课堂整理而成,侵删。该课程由上海易算生物科技有限公司CEO沈诚频博士所授。 主要知识点: --质谱数据格式 --结果报告的质控 --DDA模式的工作原理 质谱数据格式 话说,蛋白质质谱从十几年前就形成了固定的数据结构和格式 阅读全文
posted @ 2022-05-21 14:56 十年后一起潇 阅读(1414) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 说明:此篇笔记系2016-2017年由克里克学院与康昱盛主办的蛋白质组学网络大课堂整理而成,侵删。该课程由中国农业大学生物学院的李溱老师所授。 主要知识点: --质谱仪的使用与维护 --纳升液相系统的使用与维护 --液质联用系统的检查和保养 --质谱运行状态的评估 质谱仪的使用与维护 之前我们讲到了 阅读全文
posted @ 2022-05-21 00:46 十年后一起潇 阅读(1604) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 说明:此篇笔记系2016-2017年由克里克学院与康昱盛主办的蛋白质组学网络大课堂整理而成,侵删。该课程由中国农业大学生物学院的李溱老师所授。 主要知识点: --液相色谱仪及组成 --液质联用技术 液相色谱仪 1906年,一位叫Tsweet的俄国科学家,发现了这么一个现象:在一个玻璃管里放了一些碳酸 阅读全文
posted @ 2022-05-21 00:43 十年后一起潇 阅读(1202) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 说明:此篇笔记系2016-2017年由克里克学院与康昱盛主办的蛋白质组学网络大课堂整理而成,侵删。该课程由中国农业大学生物学院的李溱老师所授。 主要知识点: --质谱仪性能参数:检测限、线性范围、分辨率和质量准确度 --串联质谱类型及工作原理 --质谱辅助系统 质谱仪性能参数 我们作为质谱仪的使用者 阅读全文
posted @ 2022-05-21 00:24 十年后一起潇 阅读(1851) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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