实验室工作站jupyterhub安装笔记
本篇文章为实验室工作站的jupyterhub安装配置笔记,由于软硬件等各种区别,安装过程难免有所区别,仅供大家参考。
实验室新到一台深度学习工作站,原本想装一个juoyter notebook直接开干,但是突然想到jupyter不支持多用户同时使用,因此决定装一个jupyterhub方便大家使用(虽然目前只有我用)
参考文章:https://www.jianshu.com/p/0285feaa2ba2(文章所使用的命令有稍许拼写错误,以及路径改变,推荐按照本人笔记进行安装,若安装过程遇到其他问题,欢迎在本页面留言讨论)
机器环境:lsb_release -a
Distributor ID: Ubuntu
Description: Ubuntu 18.04 LTS
Release: 18.04
Codename: bionic
ubuntu源配置
首先将ubuntu源切换到速度较快的源,例如清华源
更新
$ sudo apt-get update #从软件源获取最新软件列表
$ sudo apt-get upgrade #根据软件列表更新本机软件
然后安装一下链接中提到的这些软件
$ sudo apt-get -y install git gcc g++ make openssl libssl-dev libbz2-dev libreadline-dev libsqlite3-dev python-dev libmysqlclient-dev
python环境的配置,首先进入root账户,以便之后配置的jupyter能够所有用户访问
$ sudo su
安装pyenv
$ cd /opt
$ git clone https://github.com/yyuu/pyenv.git pyenv
用vim打开~/.bashrc
后(vim ~/.bashrc
),添加如下的配置
export PYENV_ROOT="/opt/pyenv"
if [ -d "${PYENV_ROOT}" ]; then
export PATH=${PYENV_ROOT}/bin:$PATH
eval "$(pyenv init -)"
fi
然后读取新添加的配置
source ~/.bashrc
通过pyenv来安装anaconda
$ pyenv install anaconda3-5.3.0
然而由于网络环境原因,这一步始终无法下载,尝试使用替代方法,先手动从清华anaconda源下载anaconda-5.3.0的安装包,然后放入pyenv的根目录(上面配置过)/opt/pyenv
,这样pyenv install就会自动识别到已经下载的安装包开始安装
$ cd /opt/pyenv
$ wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/Anaconda3-5.3.0-Linux-x86_64.sh
$ pyenv install anaconda3-5.3.0
$ pyenv global anaconda3-5.3.0
利用conda安装jupyterhub和它使用的notebook
首先将conda切换为清华源(清华开源社区什么时候来把广告费结一下)
$ vim ~/.condarc
将内容修改为
channels:
- defaults
show_channel_urls: true
default_channels:
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
custom_channels:
conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
msys2: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
menpo: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
simpleitk: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
开始安装(强迫症表示必须加-v)
$ conda install -v -c conda-forge jupyterhub
$ conda install -v notebook
生成jupyter的配置文件
$ mkdir /etc/jupyterhub
$ cd /etc/jupyterhub
$ jupyterhub --generate-config
jupyter的启动配置
$ echo jupyterhub -f /etc/jupyterhub/jupyterhub_config.py > jupyterhub.sh
$ echo su -l root /etc/jupyterhub/jupyterhub.sh \& >> /etc/rc.local
配置jupyterhub用户
$ vim /etc/jupyterhub/jupyterhub_config.py #这一步大家注意,后续如果遇到http 500问题的话删除该jupyter_config.py文件或许会解决,目前我也不清楚是什么原因
- 普通用户
c.Authenticator.whitelist = {'testuser'}
- 管理员用户
c.JupyterHub.admin_users = { 'ubuntu' }
启动jupyterhub
接下来直接启动jupyterhub就可以使用了
$ jupyterhub
或者使用nphup在后台启动
$ nohup jupyterhub > jupyterhub.log &
至此安装完毕,在浏览器访问服务器ip+端口地址即可使用