转录与翻译

gene structure

transcription

1.DNA上有转录启动位点和终止位点，RNA聚合酶结合到上面，得到RNA（primary transcript）
2.RNA被切掉内含子，加上5帽子和3尾巴，得到成熟mRNA（RNA-seq研究对象）
3.mRNA到核外，翻译成蛋白。

可变剪切

可变剪切又叫选择性剪切（Alternative splicing, AS），生物的基因序列包含了外显子（exon）和内含子（intron），两者相互间隔。在mRNA前体的剪接过程中，参加剪接的外显子可以不按其线性次序剪接，内含子也可以不被切除而保留，即一个外显子或内含子是否出现在成熟mRNA中是可以选择的，转录组复杂原因之一。

剪切分类：http://mp.weixin.qq.com/s/2EC2NRPNxj_ZeNWv7qCb_w

Transcript vs isoform vs transcript variant

transcript: an expressed sequence

 

isoform：同一个基因的不同版本的蛋白，可由AS产生(one of splice variants)

transcript variant：同一个基因的不同mRNA transcript