可视化 - 随笔分类 - 萧飒

R-ggplot 引用变量及批量作图+相关性

摘要：for (i in seq(5,62,2)) { value1 <- names(phe)[i] value2 <- names(phe)[i+1] phe %>% ggplot(aes(!!sym(value1),!!sym(value2)))+geom_point()+theme_bw()+st 阅读全文

posted @ 2022-11-01 10:33 萧飒阅读(85) 评论(0) 推荐(0) 编辑

群体结构：admixture画图

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posted @ 2022-06-28 16:12 萧飒阅读(0) 评论(0) 推荐(0) 编辑

群体进化：fst_pi_tajima计算和绘图

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posted @ 2022-06-28 13:39 萧飒阅读(1) 评论(0) 推荐(0) 编辑

群体结构：kinship_PCA绘图

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posted @ 2022-06-28 10:17 萧飒阅读(1) 评论(0) 推荐(0) 编辑

GO富集图

摘要：library(readxl) library('ggplot2') #pathway=read_xlsx('BSR_down.xlsx') pathway=read_xlsx('BSR-down.xlsx') dir() Class<-pathway$GO p = ggplot(pathway,a 阅读全文

posted @ 2022-01-06 15:50 萧飒阅读(110) 评论(0) 推荐(0) 编辑

R语言画图-曼哈顿图-来源网络

摘要：#安装方法： # 设置安装源为清华大学TUNA镜像站点 options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua 阅读全文

posted @ 2022-01-04 16:24 萧飒阅读(425) 评论(0) 推荐(0) 编辑

batch gene expression plot

摘要：library(tidyverse) library(ggpubr) #load data data = readxl::read_xlsx("gene_id.xlsx",sheet = 2) data1 = pivot_longer(data,cols = c(2,3,4,5,6,7),names 阅读全文

posted @ 2021-11-23 23:20 萧飒阅读(47) 评论(0) 推荐(0) 编辑

相关性分析作图（热图+数值）/（直方图+数值）R语言

摘要：library('corrplot') library(xts) library(zoo) library(PerformanceAnalytics) setwd("F:/BaiduNetdiskWorkspace/") #读取数据 a<-readxl::read_xlsx("phe.xlsx",s 阅读全文

posted @ 2021-09-02 11:13 萧飒阅读(1577) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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