摘要:
一、测序质量值的意义 测序仪一般是按照荧光信号来判断所测序的碱基是哪一种,例如红黄蓝绿分别对于ATCG,因此,对于每个结果的判断都是一个概率的问题 Phred Quality Score:分段质量分数 Probability of incorrent base call:错误率 Base call 阅读全文
摘要:
参考:https://zhuanlan.zhihu.com/p/340449764 Base calling是一种算法(软件):可以从row images(原始图像)里通过计算机视觉的方式识别碱基类型(DNA序列),将结果写到cal文件里,最后帮助我们生成测序报告和FastQ数据。 Base Flo 阅读全文
摘要:
参考: https://zhuanlan.zhihu.com/p/61963366 一、目的 讲解二代测序如何从很短的reads拼接为一个完整的基因组(双端测序,如何对 paired-end 进行拼接) 二、单端测序 测序中最简单的办法,只有一种测序引物,使得PCR只能沿着这个引物的方向进行,所有的 阅读全文