随笔分类 - 硕士课程-生物信息
摘要：作者：黄树嘉链接：https://zhuanlan.zhihu.com/p/59767114来源：知乎 来源：https://www.jianshu.com/p/acdc4a22e30a 作者：努力呗还能咋样呐 https://www.bilibili.com/read/cv6999299 出处：b
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摘要：一、测序质量值的意义 测序仪一般是按照荧光信号来判断所测序的碱基是哪一种，例如红黄蓝绿分别对于ATCG，因此，对于每个结果的判断都是一个概率的问题 Phred Quality Score：分段质量分数 Probability of incorrent base call：错误率 Base call
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摘要：参考：https://zhuanlan.zhihu.com/p/340449764 Base calling是一种算法（软件）：可以从row images（原始图像）里通过计算机视觉的方式识别碱基类型（DNA序列），将结果写到cal文件里，最后帮助我们生成测序报告和FastQ数据。 Base Flo
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摘要：参考： https://zhuanlan.zhihu.com/p/61963366 一、目的 讲解二代测序如何从很短的reads拼接为一个完整的基因组（双端测序，如何对 paired-end 进行拼接） 二、单端测序 测序中最简单的办法，只有一种测序引物，使得PCR只能沿着这个引物的方向进行，所有的
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摘要：参考： https://zhuanlan.zhihu.com/p/190757472 二代测序 第二代高通量测序也称为下一代测序技术，相比于第一代测序通量更高、速度更快、成本更低，主要有样本制备、文库构建、测序反应等过程。 一、常用概念 泳池（flowcell）：如图所示，测序反应就发生在其上面 泳
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摘要：1、ORF：开放阅读框，开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的碱基序列，不能被终止子打断。从起始密码子开始，到终止密码子结束。前面是5‘UTR， 后面是3’UTR，ORF一般是针对mRNA来说的。 mRNA由基因序列转录得来，一个基因可能有几条不同的转录本，因而对应的ORF也可能不同
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