04 2020 档案

摘要:# Version info: R 3.2.3, Biobase 2.30.0, GEOquery 2.40.0, limma 3.26.8 # R scripts generated Tue Apr 28 04:25:19 EDT 2020 Server: www.ncbi.nlm.nih.gov 阅读全文
posted @ 2020-04-28 16:42 xiaojikuaipao 阅读(252) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:Ubuntu(Linux)系统WPS文字不能输入中文如何解决 听语音 原创 | 浏览:5591 | 更新:2017-07-04 10:19 | 标签:WPS LINUX 1 2 3 4 5 6 7 分步阅读 虽然Linux有LibreOffice,但是对微软的office兼容不是很好,有些排版会出现 阅读全文
posted @ 2020-04-22 21:27 xiaojikuaipao 阅读(1873) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:ggplot2点图+线性趋势+公式+R2+p值原创weixin_43948357 最后发布于2020-04-06 00:28:58 阅读数 13 收藏展开正文先看效果。 R语言代码如下, data("faithful")library(ggplot2)p <- ggplot(faithful,aes 阅读全文
posted @ 2020-04-17 10:26 xiaojikuaipao 阅读(1350) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:转自生信菜鸟团,如有侵权j,请联系微信:biozhangz进行删除. GTEx数据库-TCGA数据挖掘的好帮手 Posted on 2018年11月26日 通常我们在挖掘TCGA数据库的时候,会发现该项目纳入的正常组织测序结果是非常少的,也就是说很多病人都不会有他的正常组织的转录组测序结果,比如说乳 阅读全文
posted @ 2020-04-11 18:45 xiaojikuaipao 阅读(3446) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:差异计算对应生信分析非常重要 limma,genefilter 包计算差异,数据一定要转log, 因为 这两个包计算差异使用的方法是 mean(As)-mean(Bs) , 也计算是 logAmean-logBmean = log(Amean/Bmean) 这也是为什么这两个包算出来的结果直接是lo 阅读全文
posted @ 2020-04-10 23:55 xiaojikuaipao 阅读(2041) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:R语言里重要的三个函数我认为就是 apply, melt, dcast 掌握了才能入门R . m = data.frame(m = c(1,2,3,4,5,6),n=c(3,4,5,7,8,9),t=c(4,5,6,7,8,9)) h = function(x,c1,c2){ v1 = median 阅读全文
posted @ 2020-04-10 15:30 xiaojikuaipao 阅读(131) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:你终于会做截断图了,可审稿人说不让做,怎么破 https://www.sohu.com/a/166996029_170798 数据可视化真是一个蛮头疼的问题,你不停地寻找最恰当的表达方法,让好不容易做出来的实验显得更惊艳。但有时候你踏破铁鞋终于找到了,做好了,写完文章投出去了,突然审稿人提了一些出乎 阅读全文
posted @ 2020-04-02 17:48 xiaojikuaipao 阅读(1217) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:TCGA数据库下载数据 (2014-12-11 21:40:40) 转载▼ 标签: tcga数据库 分类: biology TCGA数据库是癌症基因图集(Cancer Genome Atlas,TCGA)计划,将针对不同癌症的所有基因变异进行系统分析。网址:http://cancergenome.n 阅读全文
posted @ 2020-04-02 13:23 xiaojikuaipao 阅读(947) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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